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    A test of spatial proximity as driver for social bond formation
    (2023-03-06) Cardona-Restrepo, Manuela Cardona; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    La proximidad espacial es un factor que puede promover la formación de relaciones sociales. En esta investigación plantee un experimento en el que se evaluó si la proximidad espacial puede promover la formación de relaciones sociales de bajo costo, y favorecer la formación de relaciones de cooperación (relaciones de alto costo). Para esto se usaron 23 curíes divididos en grupos de cuatro individuos en seis encierros diferentes, en los cuales controlé la familiaridad entre ellos. El experimento consistió en tres tratamientos que fueron evaluados en tres fases. En el tratamiento A los individuos podían interactuar libremente, En el tratamiento B los individuos fueron forzados a compartir un espacio y en el control, los individuos no tenían oportunidad de compartir. Los resultados sugieren que la proximidad espacial promueve la formación de relaciones sociales. Este fenómeno es más evidente cuando los individuos pueden decidir libremente si compartir el espacio con otros. Adicionalmente, las parejas de individuos que forman relaciones de forrajeo tienen mayor opción de desarrollar relaciones de alto costo. En conclusión, la proximidad espacial, especialmente la voluntaria, promueve la formación de relaciones sociales de bajo costo, y estas a su vez favorecen la formación de relaciones de cooperación.
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    Análisis comparativo de las respuestas transcripcionales de cinco especies de Leishmania frente al antimonio trivalente.
    (2021-01-25) Medina Velasquez, Julián Esteban; Ramírez, Juan David
    La leishmaniasis es considerada una enfermedad tropical desatendida para la cual no se cuenta con una vacuna. Por otra parte, las drogas de primera elección han presentado un aumento en las fallas terapéuticas, entre otras causas por la adquisición de resistencia por parte de su agente etiológico dependiente de las características propias de cada especie (ej. manifestación clínica y distribución geográfica). Así, que comprender el mecanismo usado por el parásito para sobrevivir bajo la presión de tratamientos identificando probables blancos terapéuticos comunes y específicos es importante para el control de la leishmaniasis. Sin embargo, hasta el momento no se ha realizado un análisis donde se compare la expresión génica entre especies de Leishmania que exhiben diferentes características genéticas y biológicas reflejadas en las manifestaciones clínicas diferenciales asociadas. Aquí, aplicamos análisis comparativos de los perfiles transcriptómicos de líneas con resistencia inducida experimentalmente al antimonio trivalente (SbIII) de cinco especies de importancia médica (Subgénero L. (Leishmania): L. donovani, L. infantum y L. amazonensis; Subgénero L. (Viannia): L. panamensis y L. braziliensis), causantes de diferentes manifestaciones clínicas (que generalmente son Leishmaniasis cutánea para L. panamensis y L. amazonensis, mucocutánea para L. braziliensis y visceral para L. donovani y L. infantum) a partir de análisis funcionales de ontología y asignación de grupos ortólogos. Las líneas resistentes tenían respuestas diferenciales principalmente en procesos metabólicos, unión a compuestos y componentes membranales respecto a su contraparte sensible. Predominaron los genes ortólogos diferencialmente expresados asignados a las respuestas especie especificas con un total de 1426 genes propios. A nivel de la respuesta por subgénero no se encontraron genes compartidos entre las especies pertenecientes a L. (Leishmania) y solo 7 lo fueron entre aquellas pertenecientes a L. (Viannia). No se halló ningún gen diferencialmente expresado en común entre las 5 especies, pero se encontraron dos genes ortólogos sobrerregulados comunes entre 4 especies (L. donovani, L. braziliensis, L. amazonensis y L. panamensis) referidos a una proteína de unión a RNA y al complejo NAD(P)H citocromo B5 oxidorreductasa, asociados al control transcripcional y a la síntesis de novo del ácido linoleico, importantes en los mecanismos de resistencia a los antimoniales. Estos patrones obedecen probablemente el fenómeno multifactorial de la resistencia a drogas, dependiente de características intrínsecas del parásito y el entorno. Por ende, las aproximaciones especie específicas resultan más recomendables para la proposición de potenciales blancos terapéuticos.
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    Análisis de la frecuencia de detección de Clostridium paraputrificum y los potenciales cambios en la composición de comunidades bacterianas en muestras de heces de animales de granja y domésticos
    (2023-08-22) De La Cruz Bermúdez, Emanuella; Muñoz Díaz, Marina; Camargo Mancipe, Anny
    Clostridium paraputrificum es una bacteria anaerobia Gram-positiva, móvil y formadora de esporas que causa infecciones pediátricas, enterocolitis y bacteriemia en pacientes inmunocomprometidos. En animales puede causar lesiones quitinolíticas e intestinales relacionadas con quistes gaseosos, gangrena gaseosa y enterocolitis necrotizante. La relevancia clínica ha sido poco descrita, aun cuando los reportes de caso de aislamientos de esta bacteria se asocian con infecciones graves en humanos y animales. En Colombia, se ha descrito el genoma y los factores de virulencia codificantes por C. paraputrificum en un grupo reducido de aislamiento obtenidos de humanos, pero no se ha estudiado la frecuencia de infección en humanos o animales, ni los cambios en la composición de la microbiota en presencia de este Clostridial. Debido a esto, en este estudio se determinó la frecuencia de circulación de C. paraputrifium en 302 muestras de heces de caninos, felinos y animales de granja del departamento de Boyacá y la ciudad de Bogotá, Cundinamarca usando Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Adicionalmente, se evaluó la composición de las comunidades microbianas en un subconjunto de muestras que incluyó individuos positivos y negativos para esta especie bacteriana en proporción 2:1, respectivamente. Para esto, se realizó secuenciación profunda del 16S-ARNr por la plataforma MinION (Oxford Nanopore Technologies). La frecuencia de detección global fue de C. paraputrificum en las muestras (C.par+) fue del 8% (n=24). Se encontró que la frecuencia de detección C.par+ en caninos fue del 30% (n=12), en felinos fue 6.5% (n=8), en caprinos fue 10% (n=2), en porcinos fue 2.5% (n=1) y en bovinos fue 2.5% (n=1). Una vez normalizadas las muestras y de acuerdo con la cantidad de lecturas obtenidas, se incluyeron 18 muestras C. par+ de caninos (n=9), caprinos (n=2) y felinos (n=7). El análisis de las comunidades bacterianas evidenció predominancia de los fila Proteobacteria, Bacteroidetes y Firmicutes en los tres grupos de animales. No obstante, los fila Tenericutes, Actinobacteria y Kiritimatiellaeota no fueron predominantes en las muestras la abundancia relativa de estos fue mayor en caprinos en comparación con los caninos y felinos. En los caninos y felinos los principales miembros diferencialmente abundantes fueron Faecalibacterium, Bacteroides y Bifidobacterium, mientras que, entre los caprinos, los principales miembros diferencialmente abundantes con los cuales se relacionó fueron Ruminococcaceae UCG-014, Alistipes y Escherichia-Shigella. Este estudio permitió ampliar el panorama de las diferencias en la frecuencia de detección de C. paraputrificum entre animales y su potencial relevancia en la composición de la microbiota.
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    Assessment of same-sex and opposite-sex partner preferences in guinea pigs (Cavia porcellus)
    (2024-03-19) Romero Chacón, Ana María; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    Las relaciones sociales selectivas son relaciones no fundamentales que se dan en las especies que viven en grupo, probablemente debido a los beneficios que conllevan. La preferencia de pareja son las relaciones sociales selectivas para individuos familiares y se ha evidenciado en diferentes especies a lo largo del reino animal. En este estudio, evalué la preferencia de pareja en relaciones sociales entre hembras del mismo sexo y de sexo opuesto en cobayas (Cavia porcellus). Utilicé un test de preferencia de pareja con un aparato experimental de tres cámaras en el que el individuo focal puede interactuar libremente y elegir entre un individuo familiar, uno nuevo o ninguno de ellos. Mis resultados mostraron una alta socialidad y preferencia por una pareja conocida en relaciones de sexo opuesto. La preferencia de pareja parece estar determinada por las condiciones ecológicas y sociales a las que está expuesta la especie más que a un contexto evolutivo.
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    Cambios en el bacteriana y eucariota intestinal en pacientes con blastocystis y clostridium difficile.
    (2020-01-22) Vega Romero, Laura Camila; Herrera Ossa, Giovanny Andres
    Dentro de los millones de microorganismos que componen la microbiota intestinal, Clostridium difficile y Blastocystis pueden tener un efecto modulador en diferentes maneras. El siguiente estudio tuvo como objetivo la descripción del bacterioma y eucarioma de cuatro grupos de pacientes: con coinfección por Blastocystis y C. difficile, infección únicamente por C. difficile, colonización únicamente por Blastocystis y pacientes libres de colonización/infección por estos microorganismos. Así mismo, se identificaron los subtipos de Blastocystis dentro de las muestras usando “amplicon sequencing” de los genes 16S-ARNr y 18S-ARNr. Los resultados obtenidos muestran que los subtipos más abundantes de Blastocystis fueron: ST1 (36,4%), ST3 (37,5%) y ST5 (19,3%). Aunque se ha propuesto que los ambientes de disbiosis previenen la colonización por Blastocystis, este estudio mostró una posible adaptación de Blastocystis a este escenario; gracias a los mecanismos de su hidrogenosoma y a los recursos que puede encontrar en este ambiente. De acuerdo con los resultados obtenidos, las diferencias significativas sobre la composición del bacterioma y eucarioma de los cuatro grupos se presentó sólo dentro de algunos géneros evaluados en el estudio. De esta manera, Blastocystis puede favorecer el aumento de poblaciones de bacterias benéficas de la microbiota, al cumplir con su rol predatorio. Lo anterior, ayudaría a esclarecer el estatus debatible de Blastocystis, inclinándose hacia la hipótesis de que podría ser un miembro benéfico para la microbiota intestinal. El presente estudio también brinda una visión holística sobre la competencia que existe entre los miembros de la microbiota bajo un escenario de disbiosis, especialmente en la competencia por recursos entre Blastocystis y algunos hongos. Este estudio contribuye al conocimiento de la composición de la microbiota y la interacciones de sus miembros.
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    Caracterización de comunidades bacterianas del chigüiro colombiano (Hydrochoerus hydrochaeris)
    (2024-03-20) Acevedo Ramírez, Valentina; Marín Sánchez, Jorge Arturo; Urbano, Plutarco; Ramírez González, Juan David; Muñoz, Marina; Muñoz Díaz, Marina; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) son la especie de roedores más grande del mundo, siendo nativos de Sudamérica. Esta especie exhibe una elevada importancia ecológica por sus aportes en la preservación de la biodiversidad y la salud de los ecosistemas donde habitan, además, tiene relevancia a nivel cultural y productivo (como fuente de alimento) en la región de los llanos colombianos. A pesar de esto, se desconoce la composición de las comunidades microbianas que puede transportar. El objetivo de este estudio fue caracterizar la composición de las comunidades bacterianas de chigüiros del Departamento del Casanare. Herramientas de biología molecular, como la PCR, y de secuenciación de nueva generación (NGS) como Oxford Nanopore, fueron integradas para explorar la diversidad bacteriana mediante técnicas de secuenciación profunda del gen 16S-rRNA a partir de 84 muestras pareadas de sangre, hisopados bucales e hisopados anales colectadas en dos municipios del Departamento de Casanare, Colombia (Paz de Ariporo y La Trinidad). Los resultados del estudio indican que la microbiota de los chigüiros posee una predominancia de diferentes géneros como Lactobacillus en hisopados bucales, Xanthomonadales en hisopados anales y Bdellovibrionales en sangre. Además, se observó la presencia de Bacteroides en todos los tipos de muestras, los cuales se han descrito en diferentes trabajos por cumplir funciones cruciales en la digestión y el fortalecimiento del sistema inmunológico en mamíferos. No obstante, la detección de microorganismos patógenos con potencial zoonótico, como Bacillus, Clostridium y Enterobacterales, en todas las muestras y en los dos municipios, también indica que estas comunidades de bacterias representan un riesgo para la salud pública. Este estudio proporciona información acerca de la microbiota de chigüiros por primera vez en Colombia, generando una línea de base acerca del potencial impacto en salud pública. Los resultados destacan la necesidad de implementar medidas preventivas para contener la posible propagación de infecciones, asegurando tanto la salud de las poblaciones humanas como la preservación de los chigüiros.
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    Caracterización de la microbiota eucariota en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) del departamento de Casanare, Colombia
    (2024-03-22) Marín Sánchez, Jorge Arturo; Ramírez González, Juan David; Muñoz Díaz, Clauida Marina; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La investigación de la microbiota en organismos silvestres se vuelve crucial, especialmente con la creciente interacción humana. El desarrollo de las actividades antropogénicas resalta la importancia de comprender la composición de microorganismos eucariotas en hospederos y ambientes, dado su potencial como agentes patógenos y su riesgo para la salud. Este estudio se enfoca en la caracterización de microorganismos eucariotas en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) de Casanare, Colombia, utilizando 18 muestras pareadas de hisopados anales y bucales de individuos de los municipios de Trinidad y Paz de Ariporo. Se secuencio un fragmento del gen ribosomal 18S rRNA que abarcaba las regiones hipervariables V4 hasta un fragmento de V7. Utilizando la herramienta de asignación taxonómica Kraken2, se identificó la presencia de microorganismos como Lomentospora prolificans, Trypanosoma cruzi, Coccidioides posadasii, Eimeria necatrix, Fonsecaea pedrosoi, Fusarium oxysporum, Neurospora crassa, Penicillium rubens, Phytophthora palmivora, Sarcocystis neurona, entre otros. Se identificó una baja diversidad de especies con una alta dominancia de pocas unidades taxonómicas. La presencia de estos microorganismos en las muestras analizadas se atribuye a la interacción del chigüiro con agentes portadores externos y al entorno ambiental en el que estos animales habitan. Este enfoque taxonómico proporciona una comprensión profunda de las comunidades de eucariotas asociadas con los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) en la región, destacando organismos de alta relevancia para la salud animal y humana. Los hallazgos confirman el papel de estos roedores como posibles transmisores de organismos patógenos con potencial zoonótico y contribuye a la ecoepidemiología de organismos silvestres, especialmente de los chigüiros (H. hydrochaeris).
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    Caracterización de la microbiota intestinal de bovinos raza Holstein parasitados por Fasciola spp. en Cundinamarca y Boyacá, Colombia.
    (2021-01-30) Ramírez Hernández, Angie Lorena; Ramírez, Juan David
    La identificación de alteraciones en la composición de la microbiota intestinal asociada a la presencia de parásitos ha sido un foco de atención de investigaciones por su importancia en procesos fisiológicos y de productividad animal. Dentro del campo de las relaciones hospedero-parásito, muchos estudios han sugerido que los helmintos pueden incidir sobre la composición microbiana debido a su efecto inmunomodulador. La fascioliasis bovina es una helmintiasis ampliamente estudiada en el campo de la inmunología, pero con poca información en el campo de la investigación de interacciones hospedero-helminto, por lo que se desconoce su impacto sobre las comunidades microbianas. Por esta razón, este estudio se dirige a describir la composición de la microbiota intestinal de bovinos Holstein parasitados por Fasciola provenientes del altiplano cundiboyacense colombiano, a través de un enfoque de secuenciación de nueva generación de amplicones de los genes ARNr-16S para procariotas y ARNr-18S para eucariotas. Para esto, se recolectaron 65 muestras fecales de bovinos Holstein provenientes de plantas de beneficio animal. Encontramos reducción en la abundancia relativa de Bacteroidetes y Ascomycota en las muestras de bovinos infectadas con el parásito, así como disminución en abundancia relativa de taxones comensales asociados a procesos de fermentación y digestión. Adicionalmente, se encontraron correlaciones positivas entre microorganismos que presentaron reducciones en abundancias relativas en las muestras positivas para Fasciola, lo cual se asoció a pérdida de peso consistente con el fenotipo de un bovino infectado por este parásito. Por lo anterior, se concluyó que la infección por Fasciola disminuye la capacidad de digerir material vegetal como consecuencia de la reducción en la abundancia de taxones encargados de esta función. Estos hallazgos proveen una base para futuras investigaciones sobre el desarrollo de tratamientos dirigidos a la modulación de estas poblaciones microbianas implicadas en la infección.
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    Caracterización del transcriptoma de la araña polimórfica de color Gasteracantha cacriformis, con enfoque a los genes de pigmento
    (2020-07-24) Torres Quintero, Paula Alexandra; Pardo Díaz, Geimy Carolina
    El polimorfismo de coloración es un sistema útil para estudiar procesos evolutivos y de desarrollo. No obstante, el estudio de este rasgo se ha sesgado a organismos modelo y la coloración en arácnidos no ha sido bien estudiada. La araña Gasteracantha cancriformis es una especie neotropical que presenta polimorfismo de coloración abdominal con al menos 16 morfos conocidos distribuidos desde el sur de Estados Unidos hasta el norte de Argentina. A la fecha, las bases genéticas que controlan dicho polimorfismo son desconocidas. En este estudio implementé RNAseq para ensamblar el transcriptoma de Gasteracantha, y evaluar expresión génica diferencial asociada a la coloración en hembras de color blanco, amarillo y naranja. A partir de las secuencias de los transcritos hice análisis nucleotídicos y estadísticos para establecer si existe una relación entre coloración y polimorfismos de ADN (SNPs) en el transcriptoma. En general, el perfil de expresión génica fue similar entre los fenotipos amarillo y naranja, quienes difirieron del fenotipo blanco. En los morfos amarillo y naranja dectecté mayor expresión de genes relacionados a astacina y vitelogenina, lo cual sugiere que estas coloraciones en G. cancriformis son producto de carotenoides. A nivel nucleotídico encontré que los transcritos diferencialmente expresados muestran señal asociada a fenotipo de color, pero esto no sucede a nivel de transcriptoma completo. Los datos obtenidos en este estudio proporcionan un recurso genético valioso para futuras investigaciones en arañas neotropicales y constituyen un paso fundamental hacia la identificación de las bases genéticas del polimorfismo de color en estos animales.
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    Characterization of the sexual dimorphism in oilbirds (Steatornis caripensis)
    (2022-08) Robayo Salek, Andrés Felipe; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    The extent to which males and females of monomorphic species differ from each other is still an ecological and evolutionary puzzle. In these species it has been proposed that slight differences in selection pressures can result in phenotypic differences between sexes. However, such differences may be very subtle or may be exhibited in traits that are not perceived by humans, such as coloration. For example, in blue tits (Cyanistes caeruleus) males differ from females in the UV reflection of the crown patch. Here, I aimed to identify the morphological differences between sexes in a monomorphic specie, the oilbird (Steatornis caripensis). In this species, males are slightly larger and grayish than females, making it difficult to determine the sex of individuals by means other than molecular sexing, an invasive technique. To characterize phenotypic differences between males and females, I measured five morphological traits on 75 museum individuals and 16 wild individuals, and the feather coloration in 33 museum individuals and 11 wild individuals. I used these measures to quantify the degree of sexual dimorphism and identify the traits that differentiate males from females. I found that S. caripensis is mostly monomorphic showing subtle differences in the width and the length of the bill, which is larger in males compared to females. I also found subtle differences in plumage coloration suggesting that color may play an important role in the differentiation of the sexes, and possibly in mate choice. My results indicate that despite the slight differences in beak shape between males and females, the sexes in oilbirds seem to be indistinguishable.
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    Coevolución entre Heliconius y Passiflora: una búsqueda de evidencia desde su distribución geográfica y riqueza de especies
    (2021-09-01) Sánchez Melo, Catalina Sofía; Salazar Clavijo, Camilo Andrés; Rueda, Nicol; Genética Evolutiva, Filogeografía y Ecología de Biodiversidad Neotropical
    La diversificación adaptativa de las plantas y sus insectos herbívoros podría estar influenciada por procesos de coevolución. La relación biótica entre las mariposas Heliconius y sus plantas hospederas Passiflora ha sido estudiada desde sus aspectos morfológicos, fisiológicos y de comportamiento. Sin embargo, no se ha estudiado si el grado de correlación geográfica entre sus distribuciones y riqueza es informativo respecto a su coevolución. Para esto, se modeló la riqueza y distribución de 165 especies de Passiflora y 34 de Heliconius en Colombia usando cuatro algoritmos diferentes. En ambos análisis se identificó la variable ambiental que mejor explica los patrones observados. Se comparó el patrón de distribución entre una especie monófoga H.eleuchia y sus plantas huésped y una olífaga H.cydno con sus 28 plantas huésped. El grado de solapamiento de Passiflora y Heliconius es bajo y está explicado por variables ambientales distintas –isotermalidad y estacionalidad de la precipitación, respectivamente–. Sin embargo, la variable más importante para la distribución de ambos grupos es el rango de temperatura anual. La distribución de H.eleuchia tiene una correlación más alta con sus plantas hospederas que la distribución de H.cydno, lo que es consistente con la monofagia y oligofagia de sus larvas, respectivamente. Otros factores ecológicos como la toxicidad merecen mayor atención como posibles factores que conllevan a coevolución. A escala geográfica se puede concluir que es probable que el patrón de diversificación de ambos géneros sea distinto ya que no comparten centros de riqueza y, por ende, no se trate de coevolución estricta.
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    Comparación de los perfiles de expresión génica de una cepa asociada a un presunto brote oral y un caso crónico de la enfermedad de Chagas
    (2023-07-14) Velandia González, Lina Sofia; Cruz Saavedra, Lissa; Ramirez, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Trypanosoma cruzi es el causante de la enfermedad de Chagas (CD). Los brotes orales de CD han aumentado en los últimos años, y las cepas causantes de estos se han asociado a una sintomatología aguda y mayor mortalidad. En estos brotes, el parásito expresa proteínas de familias multigénicas como la transialidasa gp82; no obstante, no se ha observado la remodelación transcriptómica que puede llevar a cabo un cepa asociada a Chagas oral. Por lo anterior, en este estudio se comparó la remodelación transcriptómica del parásito de una cepa aislada de un presunto brote oral (JJ21) y de una cepa aislada de caso crónico (MG) de CD en un modelo de infección de fibroblastos, a las 24 y 72 horas post-infección. Para ello, se analizó el transcriptoma de ambas cepas, y se evidenció los genes diferencialmente expresados (DEGs, por sus siglas en inglés), ontologías génicas y vías diferencialmente expresadas gracias a TriTrypDB y KAAS. Se encontró que en la cepa JJ21 a las 24 horas se subexpresaron DGF-1, GP63 y Ts, mientras que se sobreexpresaron las TsII, TsV, MASP y TcMUCII. A las 72 horas, en la cepa JJ21 se subexpresaron DGF-1, GP63 y TcMUCII, y que se sobreexpresaron las TcMUC. Adicionalmente, a las 72 horas de la cepa JJ21 se sobreexpresaron procesos catabólicos. De la misma manera, se reconstruyó la vía de los ribosomas para la cepa JJ21, lo que sugiere la expresión diferencial de transcritos de proteínas ribosómicas entre cepas. En conclusión, en la cepa presuntamente asociada a un brote oral se logró determinar que existe un cambio en la expresión diferencial asociada a transcritos de proteínas de ribosomas y de familias multigénicas de proteínas. Las diferencias encontradas son el primer paso para entender los cambios entre cepas con distintos mecanismos de infección a un nivel de remodelación transcriptómica.
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    Comparative genomics of Leishmania braziliensis promastigotes subjected to different temperatures
    (2019-01-17) Vásquez Carreño, Nubia Marcela; Ramírez, Juan David
    The leishmaniases are complex neglected diseases caused by the protozoan parasite Leishmania. Cutaneous leishmaniasis is the most common clinical manifestation around the world, and in the Americas the main aetiological agent is Leishmania braziliensis. In recent studies, chromosome and gene copy number variations (CNVs) have been highlighted as some mechanisms used by Leishmania species to adapt to environmental changes such as host change or drug pressure. However, no studies have described the impact of temperature shifts across the genome of Leishmania promastigotes and particularly in L. braziliensis. Therefore, we sequenced the genome (DNA-Seq) of L. braziliensis promastigotes from cultures subjected to three different temperatures, 24, 28, and 30°C; then, we analysed the aneuploidy, gene CNVs, SNPs and Indels compared with those at the control temperature (26°C). We found that the increase in temperature at 30°C had a negative effect on promastigotes proliferation; although, there were no changes in the somy, SNPs and Indels on the DNA among the three temperatures compared to the control. Only around 3% of the genes having significant copy number variation (CNVs) at each temperature showed some important genes for adaptation to temperature shifts. In conclusion, there is not a relevant genome response to the temperature shift in short-term, therefore the adaptation of this species to abiotic change could be occurring at transcriptome level. The ecological consequences are herein discussed.
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    Cuesta arriba: integración de rutas en tres dimensiones por la hormiga arriera, Atta colombica
    (2021-01-27) Cardona Hurtado, David; Riveros Rivera, Andre Josafat; Srygley, Robert B
    La integración de rutas es una estrategia de navegación ampliamente usada por muchos animales que les permite retornar a un punto de partida, mediante el procesamiento de información angular y de distancia. A pesar de que la integración de rutas está bien establecida en el plano bidimensional (2D) aún no se entiende muy bien si se extiende a la tercera dimensión (3D). Aquí investigamos si A. colombica tiene la capacidad de calcular vectores en 3D mediante el uso de diferentes experimentos en los que se modifica la inclinación y la distancia de diferentes recorridos. Los resultados indican que A. colombica es capaz de percibir los cambios en la dirección e inclinación de sus rutas e incorpora dicha información angular al integrador de rutas con las distancias al suelo correspondientes; mostrando una mejor habilidad para hacerlo en las configuraciones 3D. Estos resultados sugieren una posible representación tridimensional de su mundo, sumada a lo que podría ser una representación neural del espacio mucho más tolerante al ruido del procesamiento de la entrada y salida de información.
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    Descripción de comunidades bacterianas en afluentes del río Bogotá usando un enfoque metagenómico
    (2022-05-20) Urrea Messa, Vanessa del Pilar; Muñoz, Marina; Ramírez, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La actividad antropogénica ha generado un impacto negativo en los ambientes acuáticos y en los organismos que viven en él. Para esto se determinó la calidad del agua de las muestras tomadas en los cuatro afluentes del río Bogotá implementando estrategias tradicionales con pruebas fisicoquímicas y microbiológicas. También, se determinó la composición de las comunidades microbianas presentes por medio de análisis metagenómicos y con estos resultados, se describió la presencia de marcadores moleculares de interés en salud circundantes. Nuestros resultados muestran como la comunidad bacteriana domina en las muestras, adicional, la descripción de los marcadores de resistencia a antibióticos y factores de virulencia da un acercamiento de cómo el agua está sirviendo como medio para la propagación de estos. Finalmente, este estudio permite generar información relevante acerca del estado actual de los puntos muestreados y marca un punto de inicio para continuar con próximas investigaciones.
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    Divergencia por los Andes: vicarianza en las poblaciones de Ancylometes bogotensis (Araneae: Ctenidae)
    (2019-06-07) Gámez Vargas, Andrés Felipe; Salazar, Camilo; Salgado-Roa, Fabian Camilo
    La compleja topografía de los Andes ha facilitado múltiples eventos de diversificación promoviendo la diversidad de linajes en Suramérica. Sin embargo, poco se conoce sobre la divergencia causada por los Andes en artrópodos y en particular en arácnidos. En este estudio se evaluó la conectividad genética de poblaciones de la araña semiacuática Ancylometes bogotensis (n=42), empleando un marcador nuclear y uno mitocondrial. Ancylometes bogotensis se recuperó dentro de la familia Ctenidae, formando dos clados fuertemente estructurados por la cordillera oriental colombiana sin evidencia de flujo genético entre ellos. La diferenciación dentro de esta especie coincide con el levantamiento de dicha cordillera (~2.76Ma). Por lo tanto, este caso se constituye en uno de los pocos casos en artrópodos donde se documenta divergencia por vicarianza continental.
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    Diversity of mycorrhizal types along altitudinal gradients in mountain tropical forests of northern South America
    (2020-07-17) Rendón Espinosa, Miguel Ángel; Bottin, Marius
    Los hongos micorrízicos juegan un papel clave en el funcionamiento de los ecosistemas terrestres. Los principales tipos de asociaciones de micorrizas son micorrizas arbusculares (AM), ectomicorrizas (EcM), micorrizas ericoides (ErM) y micorrizas de orquídeas (OM). Estudios anteriores han demostrado que la abundancia de plantas AM, ECM y ErM cambia gradualmente a lo largo de gradientes latitudinales y altitudinales impulsados ​​por los efectos del clima en la descomposición, reflejados en la acumulación de carbono y nutrientes en el suelo. La cordillera de los Andes colombianos alcanza altitudes superiores a los 5.000 my es un gran sistema para probar los efectos de la altitud en los ecosistemas tropicales. Nuestro objetivo fue comprender cómo la altitud y las condiciones climáticas y del suelo dan forma a los patrones de distribución de los tipos de micorrizas en las especies de plantas distribuidas en esta región. Para probar esto, usamos una base de datos de registros de plantas de herbario y asignamos el tipo de micorrizas según la literatura disponible. También utilizamos variables bioclimáticas y edáficas a una resolución de 10 km. Calculamos la proporción de cada uno de los diferentes tipos de asociaciones de micorrizas por celda de cuadrícula y creamos un índice de diversidad para explorar su distribución espacial y su asociación con factores abióticos basados ​​en GLM. Encontramos que la diversidad de asociaciones de micorrizas aumenta con la altitud y la reserva de carbono del suelo.
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    DNA barcoding for identification and phylogenetic inference of (Diptera; Ceratopogonidae) pollinators of cacao
    (2023) Tamayo Ceballos, Iván Mateo; Richardson, James Edward; Sánchez Andrade, Adriana; Salazar Clavijo, Camilo Andrés; Yockteng, Roxana
    La pérdida de biodiversidad está ocurriendo a gran escala y la necesidad de monitorearla es cada vez más necesaria. El uso de técnicas morfológicas se puede mejorar con el uso de herramientas moleculares para ayudar a resolver los vacíos en el conocimiento de la diversidad y la historia evolutiva de las especies. El objetivo de esta investigación fue evaluar el uso del gen mitocondrial citocromo c oxidasa 1 (COI) como marcador de código de barras de ADN para caracterizar mosquitos como posibles polinizadores en cultivos de cacao colombianos. El estudio se implementó en los departamentos del Meta y Norte de Santander. Los taxones muestreados directamente de las flores se analizaron para evaluar su diversidad y relación filogenética utilizando la máxima verosimilitud (ML) y la inferencia bayesiana (BI). Generamos secuencias de aproximadamente 656 pb para 25 individuos Culicomorpha, 13 del Meta y 12 del Norte de Santander y descargamos 388 secuencias de las familias Ceratopogonidae y Chironomidae de GenBank. El análisis de las secuencias COI revela que nuestras secuencias se ubicaron en tres grupos de linajes de Ceratopogonidae (Forcipomyia, Dasyhelea y Stilobezzia) y cinco linajes no resueltos de Chironomidae. También encontramos que las especies que visitaron las flores de cacao en las plantaciones de Meta y Norte de Santander representaban dos grupos separados, que pueden estar influenciados por los procesos orogénicos de las montañas de los Andes. La reconstrucción filogenética indicó que la mayoría (n=17) de nuestras secuencias se resolvieron en el grupo Forcipomyia. Adicionalmente, ninguna de nuestras secuencias fue idéntica a las secuencias de GenBank, lo que refleja un sesgo de investigación para las regiones templadas del norte y la necesidad de más estudios sobre especies tropicales. Nuestros datos ofrecen nuevas secuencias moleculares de Ceratopogonidae colombianos para el desarrollo de un inventario global de especies polinizadoras de plantas de interés económico, como el cacao. Se sugiere también la necesidad de seguir muestreando taxones tropicales para esclarecer la historia evolutiva de estas familias de moscas.
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    Efecto de cambios ambientales en rasgos morfológicos y sensoriales asociados a la especialización de labores en la abeja de la miel Apis mellifera
    (2020-08-06) Herrera Gutiérrez, Laura Herrera; Riveros Rivera, Andre Josafat
    La división de labores es el cimiento de la organización social de los insectos. La eusocialidad se caracteriza por, además de otros factores, la división de castas laborales. Uno de los factores que determinan la asignación de labores autoorganizadas es el modelo de umbral de respuesta, que asume que la especialización depende de la variabilidad en la sensibilidad a estímulos asociados con la realización de una tarea. En el caso de Apis mellifera, la recolección de agua, polen y néctar principalmente. La disponibilidad de estos recursos puede variar en el tiempo debido a cambios en factores ambientales. En este estudio se propone que en A. mellifera la especialización en labores de recolección se relaciona con diferencias en el tamaño y número de rasgos morfológicos y sensoriales los cuales están asociado a cambios en variables ambientales a través del tiempo. Los resultados muestran que un aumento en la precipitación puede generar que las magnitudes de los rasgos morfológicos disminuyan, mientras que los rasgos sensoriales tienen un comportamiento diferente. Por otro lado, las abejas especializadas en la recolección de polen y la mezcla de polen-líquido, las cuales son similares entre sí, tienden a tener mayor tamaño corporal y número de sensilas que las recolectoras de líquido.
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    Efecto de la hipoxia y la exposición a radiaciones ionizantes sobre la captación de glucosa en líneas celulares derivadas de tumores de seno y colon
    (2021-09-05) Moreno Navarro, Paula Alejandra; Ondo Méndez, Alejandro Oyono
    El cáncer es una patología que se caracteriza por presentar una alta proliferación, heterogeneidad y supervivencia de células anormales. Bajo ambientes como hipoxia e irradiación las células tumorales inducen cambios en la expresión genética y metabólica que les permite adaptarse a las exigencias del microambiente tumoral. Gracias a procedimientos como el PET, podemos utilizar la captación de glucosa como un método para predecir la respuesta de los tumores aprovechando el alto flujo glucolítico de estas células. Debido a lo anterior, el objetivo del presente estudio fue evaluar el efecto de la hipoxia e irradiación sobre la captación de glucosa en líneas tumorales de cáncer de seno y colon usando una sonda análoga de glucosa. Aquí describimos un protocolo que usa la sonda de glucosa fluorescente (2 NBDG) en tres líneas celulares de MCF-7, HT-29 y EA.hy926 bajo distintos tratamientos experimentales, seguido de un mejoramiento de las imágenes de fluorescencia. Nuestros resultados indican una disminución en la captación de glucosa bajo el tratamiento de hipoxia y reoxigenación en las líneas celulares de EA.hy926, MCF-7 y HT29. Mientras que, en el tratamiento con irradiación, se observó un aumento significativo solamente en la línea tumoral HT-29 con respecto al control. Se sugiere que el periodo reoxigenación tuvo un efecto positivo en las células de MCF-7 y EA.hy926, mientras que en la línea tumoral HT-29 no se establece relación y se plantea un posible indicio de radioresistencia.