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Multi-gene phylogeny of the pantropical subfamily Chrysophylloideae (Sapotaceae): Evidence of generic polyphyly and extensive morphological homoplasy
Título de la revista
Autores
Swensona, Ulf
Richardson, James-Edward
Bartishc, Igor
Fecha
2008-11-01
Directores
ISSN de la revista
Título del volumen
Editor
John Wiley & Sons
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Resumen
Presentamos una filogenia molecular de 26 de los 28 géneros actualmente aceptados en la subfamilia Chrysophylloideae (Sapotaceae) utilizando parsimonia, parsimonia jackknifing e inferencia bayesiana. Se obtuvo una matriz de datos de 8984 caracteres a partir de secuencias de ADN de siete loci de cloroplasto, dos loci nucleares, indeles codificados como caracteres binarios y morfología. Nuestra reconstrucción filogenética sugiere que Chrysophyllum , Pouteria y Pradosia , así como algunas secciones dentro de Chrysophyllum y Pouteria, son todos polifiléticos. Estos taxones se describieron anteriormente en gran parte sobre la base de combinaciones únicas de estados para un conjunto de caracteres morfológicos. El mapeo de algunos de estos caracteres en uno de los árboles más parsimoniosos indica que la flor simmplesiomorfa en la subfamilia era probablemente 5-merous, tenía estambres insertados en el orificio del tubo, estaminodios, semillas con cotiledones foliáceos, radícula exsertada y endospermo. Posteriormente, estos caracteres se han perdido varias veces y no se pueden utilizar como sinapomorfias para respaldar conceptos genéricos amplios. A pesar del alto grado de homoplasia, algunos clados bien definidos pueden describirse sobre la base de combinaciones de estados de carácter alternativas. Además, muchos de estos clados bien apoyados parecen estar restringidos a áreas geográficas particulares (por ejemplo, todos los taxones en Australasia forman un grupo monofilético).Aningeria , Malacantha y Martiusella pueden finalmente resucitar, y probablemente también Donella y Gambeya , pero sus circunscripciones aún no están claras. Una especie, Chrysophyllum cuneifolium , puede haberse originado a partir de un evento de hibridación entre continentes donde el genoma materno (cpDNA) proviene de América del Sur y el genoma nuclear proviene de África.
Abstract
We present a molecular phylogeny of 26 out of the 28 currently accepted genera in the subfamily Chrysophylloideae (Sapotaceae) using parsimony, parsimony jackknifing, and Bayesian inference. A data matrix of 8984 characters was obtained from DNA sequences of seven chloroplast loci, two nuclear loci, indels coded as binary characters, and morphology. Our phylogenetic reconstruction suggests that Chrysophyllum , Pouteria , and Pradosia , as well as some sections within Chrysophyllum and Pouteria , are all polyphyletic. These taxa were previously described largely on the basis of unique combinations of states for a set of morphological characters. Mapping some of these characters onto one of the most parsimonious trees indicates that the symplesiomorphic flower in the subfamily was probably 5?merous, had stamens inserted in the tube orifice, staminodes, seeds with foliaceous cotyledons, exserted radicle, and endosperm. These characters have subsequently been lost multiple times and cannot be used as synapomorphies to support broad generic concepts. Despite the high degree of homoplasy some well?defined clades can be described on the basis of alternative character state combinations. Also, many of these well?supported clades appear to be restricted to particular geographical areas (e.g. all taxa in Australasia form a monophyletic group). Hence, we suggest that the segregate genera Aningeria , Malacantha , and Martiusella may ultimately be resurrected, and probably also Donella and Gambeya , but their circumscriptions are still unclear. One species, Chrysophyllum cuneifolium , may have originated from a hybridization event between continents where the maternal genome (cpDNA) comes from South America and the nuclear genome comes from Africa
Palabras clave
Análisis Filogenéticos , Caracteres Morfológicos , Muestreo y Nomenclatura de Taxones , Filogenia Multigenética
Keywords
Phylogenetic Analysis , Morphological Characters , Taxon Sampling and Nomenclature , Multigenetic Phylogeny
