Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)
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Análisis metabolómico del cáncer de mama en pacientes colombianas: exploración de las firmas moleculares en diferentes subtipos y estadios(2025-11-07) León Carreno, Lizeth; Pardo Rodríguez, Daniel; Hernández Rodríguez, Andrea del Pilar; Ramírez Prieto, Juliana; Lópz Molina, Ana G.; Cortés Guerra, Daniela; Camargo, Julián Alberto; Rubiano Forero, Wilson; Sandoval Hernández, Adrian; Cala, Mónica P.; Ondo Méndez, Alejandro Oyono; Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)Planteamiento del problema: El cáncer de mama es una neoplasia caracterizada por una gran heterogeneidad, influenciada por subtipos moleculares intrínsecos y el estadio clínico; aspectos que permanecen poco estudiados en la población colombiana. Métodos: Este estudio tuvo como objetivo caracterizar las alteraciones metabólicas asociadas a los subtipos y a la progresión de la enfermedad mediante un enfoque de metabolómica no dirigida en un grupo de mujeres colombianas recién diagnosticadas y sin tratamiento previo. Las muestras se analizaron utilizando LC-QTOF-MS (cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas de tiempo de vuelo con analizador de cuadrupolo) y GC-QTOF-MS (cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas de tiempo de vuelo con analizador de cuadrupolo), junto con un perfil de aminoácidos para mejorar la cobertura de metabolitos. Resultados: Se identificaron alteraciones consistentes con estudios previos; sin embargo, el subtipo Luminal B mostró niveles elevados de acilcarnitinas de cadena larga y mayores concentraciones de ácidos grasos libres en comparación con los otros subtipos. También presentó niveles elevados de carbohidratos e intermediarios glucolíticos esenciales, lo que sugiere que este subtipo podría adoptar un fenotipo metabólico híbrido caracterizado por un flujo glucolítico aumentado y un catabolismo de ácidos grasos potenciado. El análisis de estadificación TNM reveló una reprogramación metabólica progresiva del cáncer de mama. En estadios avanzados, se observó un aumento sostenido de fosfatidilcolinas y una disminución de lisofosfatidilcolinas, lo que refleja alteraciones lipídicas asociadas a funciones clave en la progresión tumoral. En estadios tempranos (I-II), en comparación con controles sanos, se identificaron metabolitos plasmáticos con alto poder discriminatorio —tales como el ácido pirrolidona glutámico, la ribosa y el glicerol—, los cuales se asocian con disfunciones en el metabolismo energético y de los carbohidratos. Conclusión: Estos resultados destacan a la metabolómica como una herramienta prometedora para el diagnóstico temprano, el seguimiento clínico y la caracterización molecular del cáncer de mama. - ÍtemAcceso Abierto
Evaluación de nanopartículas fluorescentes basadas en carbono como posibles fotosensibilizadores: respuesta biológica y electroquímica en modelos celulares cancerosos y sanos(2025-11-07) Jamaica Franco, María V.; Ramírez, Valentina; Perilla, Sonia Y.; López Molina, Gabriela; Ramírez Prieto, Juliana; Muñoz, Mariana; García, Valentina; Gutiérrez Herrera, Daniel; Caicedo Burbano, Jhon Alexander; Calvo, Paulo C.; Fonthal, Faruk; Rodríguez Burbano, Diana Carolina; Ondo Méndez, Alejandro Oyono; Grupo Givia, Semillero SyNergia, Investigación en Biomateriales para Aplicaciones Biomédica, Escuela de Medicina y Ciencias de la Salud, Universidad dica, Escuela de Medicina y Ciencias de la Salud, Universidad; Grupo de Investigación en Ingeniería Biomédica GBIO, Universidad Autónoma de Occidente. Cali, Colombia; Grupo de Invstigación Clínica; Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)El cáncer representa uno de los principales desafíos de salud a nivel global. Los tratamientos convencionales, como cirugía, quimioterapia y radioterapia, presentan limitaciones relacionadas con su carácter invasivo, efectos tóxicos y altas tasas de recurrencia. En este contexto, la terapia fotodinámica (TFD) surge como una alternativa mínimamente invasiva, basada en la generación de especies reactivas de oxígeno (ROS) por fotosensibilizadores activados con luz. Objetivo Este trabajo estudia los puntos de carbono (PC) dopados con iones lantánidos Gadolinio (Gd³⁺) e Iterbio (Yb³⁺) como agentes fotosensibilizadores mediante la evaluación de la viabilidad celular y el comportamiento electroquímico en líneas celulares epiteliales sanas (HEKa) y de cáncer de mama (MCF-7), antes y después de la irradiación ultravioleta (UV). Metodología Se sintetizaron tres nanopartículas mediante método asistido por microondas (PC, PC:Gd³⁺, y PC:Gd³⁺/Yb³⁺), y se caracterizaron para determinar sus características físico-químicas. La biocompatibilidad celular se evaluó mediante ensayo MTT pre-irradiación. Una vez establecida la concentración no citotóxica de las nanopartículas, las células fueron expuestas a irradiación UV a dos distancias (Altura 1: 4,5 cm; Altura 2: 13,1 cm). Posteriormente, se realizó impedancia electroquímica (EIS) y ensayo MTT para analizar alteraciones de membrana, y determinar viabilidad celular. Resultados Ensayos MTT pre-irradiación permitieron establecer 50 μg/mL como la concentración óptima no tóxica de las nanopartículas. Tras la irradiación UV, se observaron cambios en la impedancia y una disminución significativa en la viabilidad celular, principalmente en células tratadas con PC:Gd³⁺. Los resultados sugieren un efecto fotosensibilizador asociado a la producción de ROS, potenciado por el dopaje con Gd³⁺. Conclusiones Los resultados apoyan el potencial uso fototerapéutico de las nanopartículas basadas en carbono dopadas con iones lantánidos en TFD, evidenciando alteración en la viabilidad celular y en las propiedades electroquímicas de la membrana. Se requieren estudios adicionales para confirmar los mecanismos implicados. - ÍtemAcceso Abierto
Exploración de la nanomedicina como estrategia para la sensibilización tumoral(2025-02-26) Jamaica Franco, María V.; López Molina, Gabriela; Ramírez Prieto, Juliana; Palacio, Jose Manuel; Machuca Gutiérrez, Samuel; Tovar Romero, Hanna Valentina; Hernádez, Andrea D.; Rodríguez Burbano, Diana Carolina; Ondo Méndez, Alejandro Oyono; Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)Introducción: La eficacia de la radioterapia se limita por factores como la radiorresistencia tumoral, daño al tejido sano y depósito insuficiente de energía. La nanomedicina ofrece una potencial alternativa para superar estas barreras. Las nanopartículas con elementos de alto número atómico pueden incrementar la energía depositada, aumentando el daño al ADN. Los puntos de carbono (PC) son nanopartículas, que pueden incorporar iones como gadolinio (Gd³⁺) e iterbio (Yb³⁺) por lo que podrían potenciar el daño celular mediante mecanismos directos e indirectos. E este sentido, el objetivo del proyecto es evaluar el potencial radiosensibilizante de puntos de carbono dopados con gadolinio (Gd³⁺) e iterbio (Yb³⁺) en líneas celulares tumorales HT29 y cultivo primario (G200), analizando su influencia en la respuesta de las células tumorales antes y después de la irradiación. Metodología: Se sintetizarán puntos de carbono a partir de ácido cítrico y urea (PC). Posteriormente, se incorporarán iones lantánidos para obtener nanoplataformas de composición: i) Dopados con Gd3+ (PC: Gd³⁺) y ii) Codopados con dos iones lantánidos, Gd³⁺ e Yb³⁺ (PC: Gd³⁺/Yb³⁺). Los tres tipos de nanopartículas serán caracterizados. Mediante el ensayo de viabilidad celular MTT se evalurá cuál es la concentración óptima de nanopartículas que garantiza un mayor número de densidad electrónica sin que haya daño celular previo a la irradiación. Una vez obtenido este resultado, las células serán incubadas durante 24 horas con la concentración de nanopartículas establecida y nuevamente se evaluará la viabilidad celular, esta vez mediante el ensayo azul tripán. Para la evaluación del potencial radiosensibilizante, las células serán irradiadas en el Centro de Control de Cáncer en un acelerador lineal para uso clínico, Varian Medical Systems® TrueBeam™ (tipo de radiación: Rayos X, energía: 6 MV), con dosis que escilan entre 0 y 10 Gy, después se realizarán ensayos clonogénicos y ensayos de cometas, para medir la capacidad de las células de reproducirse y formar colonias, y la fragmentación del ADN generada por el efecto de la radiación, respectivamente. Resultados esperados: A partir de la síntesis y caracterización de las nanopartículas usadas, basada en puntos de carbono, dopados con iones lantánidos, se estudiará si se evidencia un aumento la efectividad de la radioterapia en las líneas celulares U87 y HT29 y cultivos primarios provenientes de tumor glial y se describirán los posibles efectos biológicos implicados en este proceso. Se espera evidenciar cambios en los patrones de radiosensibilidad según las condiciones a las que fueron expuestas, midiendo la capacidad de replicación celular y el daño en el ADN, mediante ensayos clonogénicos y ensayos de cometas. Esta propuesta es novedosa en el campo de la radiobiología, ya que pretende responder a limitaciones e interrogantes persistentes en cuanto a radioterapia en cáncer. Con la realización de este proyecto se busca establecer los fundamentos de una nueva técnica, más específica, que permita optimizar la respuesta al tratamiento en cáncer, mediante la aplicación de nanomedicina. - ÍtemAcceso Abierto
Exploration of serum metabolites associated with mammographic density as risk factor for breast cancer(2025-09-12) Hernández Rodríguez, Andrea del Pilar; Pardo Rodríguez, Daniel; León Carreño, Lizeth; Patiño Aldana, Andrés Felipe; Guerrero, Jose L.; Velásquez, Ariadna; Bacca, Jose; López Molina, Gabriela; Ramírez Prieto, Juliana; Mena, Harold H.; Pedraza Flechas, Ana María; Gaitán Chaparro, Sandra; Cala, Mónica P.; Ondo Méndez, Alejandro Oyono; Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)Assessing the risk of breast cancer is essential for personalized breast cancer detection and reducing morbidity and mortality rates. Mammographic density is a well-known risk factor that can improve the quality of risk-prediction models. However, discriminatory precision remains limited at the individual level. Serum metabolic differences based on the percentage of mammographic density could represent an innovative and useful risk identification tool in clinical practice. Methods: This pilot study explored the serum metabolic determinants of mammographic density as a risk factor for breast cancer in women screened at a reference hospital in Bogotá, Colombia (2021). Based on mammographic density percentages, 60 patients were classified into breast cancer risk groups: low (<25%), intermediate (25–50%), and high (>50%). An untargeted metabolomics approach was employed to investigate metabolic alterations associated with these risk levels, using GC-QTOF-MS (Gas Chromatography–Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry) and LC-QTOF-MS (Liquid Chromatography–Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometry) for metabolomics and LC-QTOF-MS for lipidomics. To determine statistically significant differences among the MD groups, both univariate (UVA) and multivariate (MVA) analyses were performed Results: Among the three density groups, only the comparison between high and low mammographic density revealed significant differences, six metabolites met the quality criteria and demonstrated good discriminatory ability (AUC > 0.78): tyrosine, glycerol, monopalmitin, tetradecanoylcarnitine, prostaglandin PGE2 glyceryl ester, and ketoglutaric acid. Conclusion: These findings suggest that metabolic profiles could be valuable tools for improving risk assessment prediction models. However, its clinical applicability should be evaluated in future prospective studies. - ÍtemAcceso Abierto
Metabolomic analysis of breast cancer in colombian patients: exploring molecular signatures in different subtypes and stages(2025-09-13) León Carreño, Lizeth; Pardo Rodríguez, Daniel; Hernández Rodríguez, Andrea del Pilar; Ramírez Prieto, Juliana; López Molina, Gabriela; Claros, Ana G.; Cortes Guerrero, Daniela; Camargo, Julian Alberto; Rubiano Forero, Wilson; Sandoval Hernández, Adrian; Cala, Mónica P.; Ondo Méndez, Alejandro Oyono; Semillero de Bioquímica, Cáncer y Radiobiología (SiBio)Planteamiento del problema: El cáncer de mama es una neoplasia caracterizada por una gran heterogeneidad, influenciada por subtipos moleculares intrínsecos y el estadio clínico; aspectos que permanecen poco estudiados en la población colombiana. Métodos: Este estudio tuvo como objetivo caracterizar las alteraciones metabólicas asociadas a los subtipos y a la progresión de la enfermedad mediante un enfoque de metabolómica no dirigida en un grupo de mujeres colombianas recién diagnosticadas y sin tratamiento previo. Las muestras se analizaron utilizando LC-QTOF-MS (cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas de tiempo de vuelo con analizador de cuadrupolo) y GC-QTOF-MS (cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas de tiempo de vuelo con analizador de cuadrupolo), junto con un perfil de aminoácidos para mejorar la cobertura de metabolitos. Resultados: Se identificaron alteraciones consistentes con estudios previos; sin embargo, el subtipo Luminal B mostró niveles elevados de acilcarnitinas de cadena larga y mayores concentraciones de ácidos grasos libres en comparación con los otros subtipos. También presentó niveles elevados de carbohidratos e intermediarios glucolíticos esenciales, lo que sugiere que este subtipo podría adoptar un fenotipo metabólico híbrido caracterizado por un flujo glucolítico aumentado y un catabolismo de ácidos grasos potenciado. El análisis de estadificación TNM reveló una reprogramación metabólica progresiva del cáncer de mama. En estadios avanzados, se observó un aumento sostenido de fosfatidilcolinas y una disminución de lisofosfatidilcolinas, lo que refleja alteraciones lipídicas asociadas a funciones clave en la progresión tumoral. En estadios tempranos (I-II), en comparación con controles sanos, se identificaron metabolitos plasmáticos con alto poder discriminatorio —tales como el ácido pirrolidona glutámico, la ribosa y el glicerol—, los cuales se asocian con disfunciones en el metabolismo energético y de los carbohidratos. Conclusión: Estos resultados destacan a la metabolómica como una herramienta prometedora para el diagnóstico temprano, el seguimiento clínico y la caracterización molecular del cáncer de mama.



