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Testing quantitative genetic hypotheses about the evolutionary rate matrix for continuous characters
| dc.creator | Revell, Liam James | spa |
| dc.date.accessioned | 2020-08-19T14:40:49Z | |
| dc.date.available | 2020-08-19T14:40:49Z | |
| dc.date.created | 2008-01-01 | spa |
| dc.description | Proporcionar un nuevo enfoque de prueba de hipótesis multivariante para la evolución de caracteres continuos en un contexto filogenético. Antecedentes: el movimiento browniano es el modelo más utilizado para la evolución de rasgos cuantitativos. Bajo el movimiento browniano multivariado, la evolución de múltiples rasgos continuos puede describirse mediante una matriz de tasa evolutiva en la que los elementos diagonales determinan la tasa de evolución de los caracteres individuales, mientras que los elementos fuera de la diagonal determinan el grado en que los diferentes personajes co-evolucionan. Método: Presentamos pruebas de verosimilitud para dos hipótesis simples sobre la matriz de tasas evolutivas: (1) igualdad o proporcionalidad a una matriz hipotética; y (2) cambio concertado en la matriz de tasas en una determinada porción o porciones del árbol filogenético. En el caso (1), la matriz hipotética podría estimarse a partir de la matriz de varianza-covarianza genética aditiva dentro de la especie. En el caso (2), un cambio concertado en la matriz de tasa evolutiva podría resultar de cambios en el nivel de ploidía o la tasa de mutación. Ilustramos estas pruebas de hipótesis utilizando datos de simulaciones genéticas cuantitativas basadas en individuos en árboles filogenéticos estocásticos. Resultados: Nuestro estimador de matriz de tasas evolutivas mostró un sesgo mínimo. Los errores de tipo I en nuestras pruebas basadas en la verosimilitud para la igualdad y proporcionalidad de la matriz estaban muy cerca de los niveles apropiados. El poder para detectar la selección también fue suficiente, excepto en el caso de la selección más débil simulada en este estudio. El error de tipo I y la precisión de la estimación de los parámetros en la prueba de heterogeneidad de la matriz de tasas también fueron adecuados. | spa |
| dc.description.abstract | Aim: Provide a new multivariate hypothesis testing approach for the evolution of continuous characters in a phylogenetic context. Background: Brownian motion is the most commonly used model for the evolution of quantitative traits. Under multivariate Brownian motion, the evolution of multiple continuous traits can be described by an evolutionary rate matrix in which the diagonal elements determine the rate of evolution for individual characters, while the off-diagonal elements determine the extent to which different characters co-evolve. Method: We present likelihood tests for two simple hypotheses about the evolutionary rate matrix: (1) equality or proportionality to a hypothetical matrix; and (2) concerted change in the rate matrix in a certain portion or portions of the phylogenetic tree. In case (1), the hypothetical matrix might be estimated from the within-species additive genetic variance-covariance matrix. In case (2), concerted change in the evolutionary rate matrix might result from shifts in ploidy level or the mutation rate. We illustrate these hypothesis tests using data from individual-based quantitative genetic simulations on stochastic phylogenetic trees. Results: Our evolutionary rate matrix estimator exhibited minimal bias. Type I errors in our likelihood-based tests for matrix equality and proportionality were very close to appropriate levels. Power to detect selection was also sufficient, except in the case of the weakest selection simulated in this study. Type I error and the accuracy of parameter estimation in the test for rate matrix heterogeneity were also adequate. © 2008 Liam J. Revell. | spa |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.issn | ISSN: 1522-0614 | |
| dc.identifier.uri | https://repository.urosario.edu.co/handle/10336/27036 | |
| dc.language.iso | eng | spa |
| dc.publisher | Evolutionary Ecology | spa |
| dc.relation.citationEndPage | 331. | |
| dc.relation.citationIssue | No. 3 | |
| dc.relation.citationStartPage | 311 | |
| dc.relation.citationTitle | Evolutionary Ecology Research | |
| dc.relation.citationVolume | Vol. 10 | |
| dc.relation.ispartof | Evolutionary Ecology Research, ISSN: 1522-0614 Vol.10, No.3 (2008);pp.311-331. | spa |
| dc.relation.uri | http://www.evolutionary-ecology.com/issues/v10n03/ccar2235.pdf | spa |
| dc.rights.accesRights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.acceso | Abierto (Texto Completo) | spa |
| dc.source | Evolutionary Ecology Research | spa |
| dc.source.instname | instname:Universidad del Rosario | |
| dc.source.reponame | reponame:Repositorio Institucional EdocUR | |
| dc.subject | Movimiento Browniano | spa |
| dc.subject | Método Comparativo | spa |
| dc.subject | Restricción Evolutiva | spa |
| dc.subject | Restricción genética | spa |
| dc.subject | Mínimos Cuadrados Generalizados Filogenéticos | spa |
| dc.subject | Máxima Verosimilitud | spa |
| dc.subject | Filogenia. | spa |
| dc.subject.keyword | Brownian Movement | spa |
| dc.subject.keyword | Comparative Method | spa |
| dc.subject.keyword | Evolutionary Constraint | spa |
| dc.subject.keyword | Genetic restriction | spa |
| dc.subject.keyword | Phylogenetic Generalized Least Squares | spa |
| dc.subject.keyword | Maximum Likelihood | spa |
| dc.subject.keyword | Phylogeny. | spa |
| dc.title | Testing quantitative genetic hypotheses about the evolutionary rate matrix for continuous characters | spa |
| dc.title.TranslatedTitle | Prueba de hipótesis genéticas cuantitativas sobre la matriz de tasas evolutivas para caracteres continuos | spa |
| dc.type | article | eng |
| dc.type.hasVersion | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | |
| dc.type.spa | Artículo | spa |
