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High-throughput analysis of the Trypanosoma cruzi minicirculome (mcDNA) unveils structural variation and functional diversity

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dc.creatorGómez-Palacio, Andrésspa
dc.creatorPita, Sebastiánspa
dc.creatorCruz-Saavedra, Lissaspa
dc.creatorVan den Broeck, Frederikspa
dc.creatorGeerts, Manonspa
dc.creatorVallejo, Gustavo A.spa
dc.creatorCarranza, Julio C.spa
dc.creatorRamírez, Juan Davidspa
dc.date.accessioned2024-07-08T16:52:12Z
dc.date.available2024-07-08T16:52:12Z
dc.date.created2024-12-01spa
dc.date.issued2024-12-01spa
dc.descriptionTrypanosoma cruzi causa la enfermedad de Chagas y tiene un genoma extranuclear único encerrado en una estructura llamada cinetoplasto, que contiene genomas circulares conocidos como maxi y minicírculos. Si bien la estructura y función de los maxicírculos se comprenden bien, aún quedan muchos aspectos de los minicírculos por descubrir. Aquí, realizamos un análisis de alto rendimiento del minicirculoma (mcDNA) en 50 clones aislados de las diversas poblaciones de T. cruzi I de Colombia. Los resultados indican que el mcDNA comprende cuatro subpoblaciones diversas con diferentes estructuras, longitudes y números de regiones semiconservadas (anteriormente denominadas regiones ultraconservadas mHCV) e hipervariables (mHVP) intercaladas. El análisis de la ascendencia del mcDNA y la diferenciación entre clones indica que el mestizaje de clases de secuencias de minicírculos se realiza a lo largo de diversas cepas y huéspedes. Estos resultados respaldan la evidencia de la dinámica multiclonal y la segregación biparental aleatoria. Finalmente, divulgamos el repertorio de ARN guía codificado por mcDNA a escala clonal, y se discuten varios atributos de su abundancia y función.spa
dc.description.abstractTrypanosoma cruzi causes Chagas disease and has a unique extranuclear genome enclosed in a structure called the kinetoplast, which contains circular genomes known as maxi- and minicircles. While the structure and function of maxicircles are well-understood, many aspects of minicircles remain to be discovered. Here, we performed a high-throughput analysis of the minicirculome (mcDNA) in 50 clones isolated from Colombia’s diverse T. cruzi I populations. Results indicate that mcDNA comprises four diverse subpopulations with different structures, lengths, and numbers of interspersed semi-conserved (previously termed ultra-conserved regions mHCV) and hypervariable (mHVPs) regions. Analysis of mcDNA ancestry and inter-clone differentiation indicates the interbreeding of minicircle sequence classes is placed along diverse strains and hosts. These results support evidence of the multiclonal dynamics and random bi-parental segregation. Finally, we disclosed the guide RNA repertoire encoded by mcDNA at a clonal scale, and several attributes of its abundance and function are discussed.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1038/s41598-024-56076-4spa
dc.identifier.urihttps://repository.urosario.edu.co/handle/10336/42910
dc.language.isoengspa
dc.relation.ispartofScientific Reportsspa
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalspa
dc.rights.accesRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.accesoAbierto (Texto Completo)spa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/spa
dc.sourceScientific Reportsspa
dc.source.instnameinstname:Universidad del Rosariospa
dc.source.reponamereponame:Repositorio Institucional EdocURspa
dc.subjectTrypanosoma cruzispa
dc.subjectMaxicírculosspa
dc.subjectMinicírculosspa
dc.subjectADNkspa
dc.subjectARN guíaspa
dc.subjectColombiaspa
dc.subjectEnfermedad de Chagasspa
dc.subject.keywordTrypanosoma cruzieng
dc.subject.keywordMaxicircleseng
dc.subject.keywordMinicircleseng
dc.subject.keywordkDNAeng
dc.subject.keywordGuide RNAeng
dc.subject.keywordColombiaeng
dc.subject.keywordChagas diseaseeng
dc.titleHigh-throughput analysis of the Trypanosoma cruzi minicirculome (mcDNA) unveils structural variation and functional diversityspa
dc.typearticlespa
dc.type.hasVersioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.type.spaArtículo de Investigaciónspa
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