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Co-expression of the mammaglobin (SCGB2A2) gene with hsa-miR-184 and hsa-miR-190b indicates their possible role in different oncogenic pathways in Breast cancer
Título de la revista
Autores
Abella Duque, Juan Felipe
López Kleine, Liliana
Ramírez Clavijo, Sandra Rocío
Payán Gómez, César
Fecha
2024-12-02
Directores
Ramírez Clavijo, Sandra Rocío
Payán Gómez, César
ISSN de la revista
Título del volumen
Editor
Universidad del Rosario
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Resumen
Introducción: El cáncer de mama es el cáncer más común en mujeres a nivel mundial, y su detección temprana sigue siendo un desafío importante. Estudios recientes han identificado una mayor expresión del ARNm de la mamaglobina A (SCGB2A2) en el cáncer de mama, lo que sugiere su potencial como marcador de enfermedad, aunque su función no se comprende completamente. Este estudio identifica microARN (miARN) coexpresados con SCGB2A2, cuyas vías de señalización permiten comprender mejor el papel de SCGB2A2 en el cáncer de mama. Materiales y Métodos: Utilizando TCGAbiolinks y Firebrowse, se obtuvieron datos de miARN y expresión génica de 86 pacientes, con una muestra tumoral y una muestra de tejido normal por paciente, de la cohorte de cáncer de mama de TCGA. Los datos transcriptómicos se analizaron con DESeq2 y se calculó una correlación de Spearman para los valores p significativos, que se analizaron posteriormente utilizando herramientas de enriquecimiento y bases de datos de genes diana. Resultados: Entre los 782 miRNA expresados en cáncer de mama, solo dos, hsa-mir-184 y hsa-mir-190b, mostraron la correlación positiva más fuerte con SCGB2A. Estos miRNA también mostraron una expresión positiva en tejidos de cáncer de mama en comparación con los de tejidos normales. El análisis bioinformático sugiere que hsa-mir-184 y hsa-mir-190b desempeñan un papel importante en la proliferación celular y el control del ciclo celular. Cabe destacar que estos miRNA se han asociado previamente con el cáncer de mama. No se encontró ningún miRNA con una correlación negativa con SCGB2A2. Estos miRNA se dirigen a una amplia gama de genes, incluyendo TP53, ESR1 y MYC, que están implicados en procesos relacionados con el cáncer, como la apoptosis y la regulación del ciclo celular. Conclusiones: La correlación positiva entre hsa-mir-184 y hsa-mir-190b y la expresión de SCGB2A2 muestra que podrían participar en la misma vía de señalización. Sin embargo, en lugar de modular directamente la expresión de SCGB2A2, estos modulan la expresión de los genes SNX9 y ANXA6 en el tejido tumoral mamario. Estos participan en procesos celulares críticos, como el tráfico de membrana y la señalización celular, y se alteran con frecuencia en el cáncer, lo que los convierte en posibles dianas para la regulación de miRNA. Además, esta información nos permite comprender mejor el posible papel de la mamaglobina en las vías de señalización celular relacionadas con el cáncer de mama y contribuye al desarrollo de estrategias terapéuticas específicas.
Abstract
Background: Breast cancer is the most common cancer in women worldwide, and early detection remains a significant challenge. Recent studies have identified increased expression of Mammaglobin A (SCGB2A2) mRNA in breast cancer, suggesting its potential as a disease marker, although its function is not fully understood. This study identifies microRNAs (miRNAs) co-expressed with SCGB2A2, which signaling pathways to better understand SCGB2A2's role in breast cancer. Methods: Using TCGAbiolinks and Firebrowse, miRNA and gene expression data were obtained from 86 patients, with one tumor sample and one normal tissue sample per patient from the TCGA Breast Cancer cohort. Transcriptomic data were analyzed with DESeq2, and a Spearman correlation was calculated for significant p-values, which were further analyzed using enrichment tools and target gene databases. Results: Among the 782 miRNAs expressed in breast cancer, only two, hsa-mir-184 and hsa mir-190b, showed the strongest positive correlation with SCGB2A. These miRNAs were also upregulated in breast cancer tissues compared with those in normal tissues. The bioinformatics analysis suggests that hsa-mir-184 and hsa-mir-190b play significant roles in cellular proliferation and cell cycle control. Notably, these miRNAs have been previously associated with breast cancer. No miRNAs were found to have a negative correlation with SCGB2A2. These miRNAs target a broad range of genes, including TP53, ESR1, and MYC, which are implicated in cancer-related processes such as apoptosis and cell cycle regulation. Conclusions: The positive correlation between hsa-mir-184 and hsa-mir-190b and SCGB2A2 expression shows that they could participate in the same signaling pathway. However, rather than directly modulating SCGB2A2 expression, these are modulators of SNX9 and ANXA6 gene expression in the breast tumor tissue. These are involved in critical cellular processes, such as membrane trafficking and cell signaling, and are frequently disrupted in cancer, making them plausible targets for miRNA regulation. In addition, this information allows us to better understand the possible role of mammaglobin in cell signaling pathways related to breast cancer and contributes to the development of targeted therapeutic strategies.
Palabras clave
MicroARN (miARN) , Secretoglobina SCGB2A2 (SCGB2A2) , hsa-mir-184 , hsa-mir-190b , Cáncer de mama
Keywords
MicroRNAs (miRNAs) , Secretoglobin B2A2 (SCGB2A2) , hsa-mir-184 , hsa-mir-190b , Breast cancer
