Ítem
Acceso Abierto

The experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazil

Mostrar el registro sencillo de la publicación
dc.creatorZuvanov, Luíza
dc.creatorBasso Garcia, Ana Letycia
dc.creatorHenrique Correr, Fernando
dc.creatorBizarria Júnior, Rodolfo
dc.creatorCosta Filho, Ailton
dc.creatorHayasi da Costa, Alisson
dc.creatorThomaz, Andrea
dc.creatorPinheiro, Ana Lucia
dc.creatorRiaño-Pachón, Diego Mauricio
dc.creatorVischi Winck, Flavia
dc.creatorEsteves, Franciele
dc.creatorRodrigues Alves Margarido, Gabriel
dc.creatorStanfoca Casagrande, Giovanna Maria
dc.creatorFrajacomo, Henrique
dc.creatorMartins, Leonardo
dc.creatorFeitosa Cavalheiro, Mariana
dc.creatorGraf Grachet, Nathalia
dc.creatorSilva, Raniere
dc.creatorCerri, Ricardo
dc.creatorRamos, Rommel
dc.creatorMedeiros, Simone Daniela Sartorio de
dc.creatorTavares, Thayana
dc.creatorCorrêa dos Santos, Renato Augusto
dc.date.accessioned2022-09-01T20:01:48Z
dc.date.available2022-09-01T20:01:48Z
dc.date.created2021-11-11
dc.date.issued2021-11-11
dc.descriptionLa biología computacional ha ganado fuerza como disciplina científica independiente en los últimos años en América del Sur. Sin embargo, todavía existe una necesidad creciente de biocientíficos, de diferentes orígenes y con diferentes niveles, para adquirir habilidades de programación, lo que podría reducir el tiempo de los datos a los conocimientos y conectar la comunicación entre los científicos de la vida y los informáticos. Python es un lenguaje de programación ampliamente utilizado en bioinformática y ciencia de datos, que es particularmente adecuado para principiantes. Aquí, describimos la concepción, organización e implementación del Taller Brasileño de Python para Datos Biológicos. Este taller ha sido organizado por estudiantes de pregrado y posgrado y apoyado, principalmente en asuntos administrativos, por profesores experimentados desde 2017. El taller fue concebido para enseñar a biocientíficos, principalmente estudiantes en Brasil, sobre cómo programar en un contexto biológico. El objetivo de este artículo fue compartir nuestra experiencia con la edición 2020 del taller en su formato virtual debido a la pandemia de la Enfermedad por Coronavirus 2019 (COVID-19) y comparar y contrastar la experiencia de este año con las ediciones presenciales anteriores. Describimos un modelo de taller práctico y de codificación en vivo para enseñar la programación introductoria de Python. También destacamos las adaptaciones realizadas de formato presencial a online en 2020, la evaluación de los participantes sobre la progresión del aprendizaje y la gestión general del taller. Por último, brindamos un resumen y reflexiones de nuestras experiencias personales de los talleres de los últimos 4 años. Nuestras conclusiones incluyeron los beneficios del aprendizaje a partir de los comentarios de los alumnos (LLF, por sus siglas en inglés) que nos permitieron mejorar el taller en tiempo real, a corto y probablemente a largo plazo. Concluimos que el Taller Brasileño de Python para Datos Biológicos es un modelo de taller altamente efectivo para la enseñanza de un lenguaje de programación que permite a los biocientíficos ir más allá de una exploración inicial de habilidades de programación para el análisis de datos a mediano y largo plazo.es
dc.description.abstractComputational biology has gained traction as an independent scientific discipline over the last years in South America. However, there is still a growing need for bioscientists, from different backgrounds, with different levels, to acquire programming skills, which could reduce the time from data to insights and bridge communication between life scientists and computer scientists. Python is a programming language extensively used in bioinformatics and data science, which is particularly suitable for beginners. Here, we describe the conception, organization, and implementation of the Brazilian Python Workshop for Biological Data. This workshop has been organized by graduate and undergraduate students and supported, mostly in administrative matters, by experienced faculty members since 2017. The workshop was conceived for teaching bioscientists, mainly students in Brazil, on how to program in a biological context. The goal of this article was to share our experience with the 2020 edition of the workshop in its virtual format due to the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic and to compare and contrast this year’s experience with the previous in-person editions. We described a hands-on and live coding workshop model for teaching introductory Python programming. We also highlighted the adaptations made from in-person to online format in 2020, the participants’ assessment of learning progression, and general workshop management. Lastly, we provided a summary and reflections from our personal experiences from the workshops of the last 4 years. Our takeaways included the benefits of the learning from learners’ feedback (LLF) that allowed us to improve the workshop in real time, in the short, and likely in the long term. We concluded that the Brazilian Python Workshop for Biological Data is a highly effective workshop model for teaching a programming language that allows bioscientists to go beyond an initial exploration of programming skills for data analysis in the medium to long term.es
dc.format.extent16 ppes
dc.format.mimetypeapplication/pdfes
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009534es
dc.identifier.issn1553-7358es
dc.identifier.urihttps://repository.urosario.edu.co/handle/10336/35096
dc.language.isoenges
dc.relation.urihttps://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1009534es
dc.rightsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia*
dc.rights.accesRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses
dc.rights.accesoAbierto (Texto Completo)es
dc.rights.licenciaEL AUTOR, manifiesta que la obra objeto de la presente autorización es original y la realizó sin violar o usurpar derechos de autor de terceros, por lo tanto la obra es de exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre la misma. PARGRAFO: En caso de presentarse cualquier reclamación o acción por parte de un tercero en cuanto a los derechos de autor sobre la obra en cuestión, EL AUTOR, asumirá toda la responsabilidad, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos la universidad actúa como un tercero de buena fe. EL AUTOR, autoriza a LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, Ley 44 de 1993, Decisión andina 351 de 1993, Decreto 460 de 1995 y demás normas generales sobre la materia, utilice y use la obra objeto de la presente autorización. -------------------------------------- POLITICA DE TRATAMIENTO DE DATOS PERSONALES. Declaro que autorizo previa y de forma informada el tratamiento de mis datos personales por parte de LA UNIVERSIDAD DEL ROSARIO para fines académicos y en aplicación de convenios con terceros o servicios conexos con actividades propias de la academia, con estricto cumplimiento de los principios de ley. Para el correcto ejercicio de mi derecho de habeas data cuento con la cuenta de correo habeasdata@urosario.edu.co, donde previa identificación podré solicitar la consulta, corrección y supresión de mis datos.spa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/*
dc.source.instnameinstname:Universidad del Rosariospa
dc.source.reponamereponame:Repositorio Institucional EdocURspa
dc.subjectBiología computacionales
dc.subjectBiociencias Brasiles
dc.subjectLenguajes de programaciónes
dc.subjectPythones
dc.subjectVisualización de datoses
dc.subjectHabilidades de programaciónes
dc.subjectTalleres de formaciónes
dc.subjectDatos biológicoses
dc.subjectMétodos de enseñanzaes
dc.subjectBiological dataes
dc.subject.ddcTecnología (Ciencias aplicadas)es
dc.subject.ddcCiencias naturales & matemáticases
dc.subject.keywordComputational biologyes
dc.subject.keywordBiosciences Braziles
dc.subject.keywordProgramming languageses
dc.subject.keywordPythones
dc.subject.keywordData visualizationes
dc.subject.keywordProgramming skillses
dc.subject.keywordInformation workshopses
dc.subject.keywordTeaching methodses
dc.titleThe experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Braziles
dc.title.TranslatedTitleLa experiencia de enseñar habilidades de programación introductoria a biocientíficos en Brasiles
dc.typearticlees
dc.type.hasVersioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones
dc.type.spaArtículoes
Archivos
Bloque original
Mostrando1 - 1 de 1
Miniatura
Nombre:
The-experience-of-teaching.pdf
Tamaño:
968.02 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descripción:
Descargar
Colecciones
Artículos