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Acceso Abierto

Genomics of novel influenza A virus (H18N12) in bats, Caribe Colombia

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dc.creatorEcheverri-De la Hoz, Daniel
dc.creatorMartínez-Bravo, Caty
dc.creatorGastelbondo-Pastrana, Bertha
dc.creatorRivero, Ricardo
dc.creatorLópez, Yesica
dc.creatorBertel, Valeria
dc.creatorAlemán-Santos, Maira
dc.creatorGaray, Evelin
dc.creatorHoyos, Richard
dc.creatorArrieta, Germán
dc.creatorRamírez, Juan David
dc.creatorMattar, Salim
dc.date.accessioned2026-02-05T17:25:22Z
dc.date.available2026-02-05T17:25:22Z
dc.date.created2025-02-18
dc.descriptionLos virus de la influenza tienen una alta capacidad de mutar y adaptarse en huéspedes mamíferos. Si bien estos virus se han estudiado ampliamente en aves, la investigación sobre su presencia en murciélagos ha sido limitada. Sin embargo, los virus de la influenza que circulan en murciélagos han mostrado una notable divergencia molecular. El presente estudio tuvo como objetivo caracterizar las relaciones filogenéticas, evolutivas y antigénicas de un virus de influenza A detectado en el murciélago pescador Noctilio albiventris. Como parte de un estudio de vigilancia de patógenos de interés para la salud pública, se recolectaron 159 muestras rectales de murciélagos en el Caribe colombiano. Las muestras se secuenciaron mediante RNA-Seq. Se identificó un genoma (ocho contigs virales) asociado con la familia Orthomyxoviridae en un pool. La mayoría de los segmentos mostraron aproximadamente un 90% de similitud con el virus H18N11, excepto la neuraminidasa. El análisis de la proteína N muestra que ocupa una posición basal con respecto al subtipo N11, y su divergencia se estima aproximadamente 50 años antes que la secuencia N11 más antigua reportada. El modelado 3D identificó tres mutaciones (K363R, T242K e I139V), que podrían potenciar la interacción con el HLA-DR de los murciélagos. Los análisis y la divergencia antigénica observada en la proteína N de N. albiventris sugieren la existencia de un nuevo subtipo (H18N12) con patogenicidad desconocida, que requiere mayor investigación.
dc.description.abstractInfluenza viruses are highly capable of mutating and adapting in mammalian hosts. While these viruses have been extensively studied in birds, research on their presence in bats has been limited. However, influenza viruses circulating in bats have shown notable molecular divergence. The present study aimed to characterize the phylogenetic, evolutionary, and antigenic relationships of an influenza A virus detected in the fishing bat Noctilio albiventris. As part of a pathogen surveillance study of public health interest, 159 rectal samples were collected from bats in the Colombian Caribbean. The samples were sequenced using RNA-Seq.A genome (eight viral contigs) associated with the Orthomyxoviridae family was identified in a pool. Most segments showed approximately 90% similarity with H18N11, except for the neuraminidase. Analysis of the N protein shows that occupies a basal position relative to the N11 subtype, with its divergence date estimated to be approximately 50 years earlier than the earliest reported N11 sequence. 3D modeling identified three mutations (K363R, T242K, and I139V), which may enhance interaction with the HLA-DR of bats. The analyses and antigenic divergence observed in the N protein of N. albiventris suggests the existence of a new subtype (H18N12) with unknown pathogenicity, which requires further investigation.
dc.format.extent11 pp
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1038/s41598-025-91026-8
dc.identifier.urihttps://repository.urosario.edu.co/handle/10336/47460
dc.language.isoeng
dc.rightsAttribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International*
dc.rights.accesRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accesoAbierto (Texto completo)spa
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dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.source.bibliographicCitationGupta, P. et al. Bats and viruses: a death-defying friendship. VirusDisease 32, 467–479 URL (2021). https://link.springer.com/artic le/10.1007/s13337-021-00716-0
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dc.source.bibliographicCitationCalderón, A. et al. Two cases of natural infection of dengue-2 virus in bats in the colombian caribbean. Tropical Medicine and Infectious Disease 6, 35 URL (2021). https://www.mdpi.com/2414-6366/6/1/35
dc.source.bibliographicCitationTong, S. et al. A distinct lineage of influenza a virus from bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109, 4269–4274 (2012). https://doi.org/10.1073/pnas.1116200109
dc.source.instnameinstname:Universidad del Rosariospa
dc.source.reponamereponame:Repositorio Institucional EdocURspa
dc.subjectNeuraminidasa
dc.subjectNoctilio albiventris
dc.subjectMurciélagos neotropicales
dc.subjectAdaptabilidad
dc.subjectOrtomyxoviridae
dc.subject.keywordNeuraminidase
dc.subject.keywordNoctilio albiventris
dc.subject.keywordNeotropical bats
dc.subject.keywordAdaptability
dc.subject.keywordOrtomyxoviridae
dc.titleGenomics of novel influenza A virus (H18N12) in bats, Caribe Colombia
dc.typejournalArticle
dc.type.hasVersioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.spaArtículo
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