Pregrado en Biología

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Examinando Pregrado en Biología por Director "Ramírez, Juan David"

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    Análisis comparativo de las respuestas transcripcionales de cinco especies de Leishmania frente al antimonio trivalente.
    (2021-01-25) Medina Velasquez, Julián Esteban; Ramírez, Juan David
    La leishmaniasis es considerada una enfermedad tropical desatendida para la cual no se cuenta con una vacuna. Por otra parte, las drogas de primera elección han presentado un aumento en las fallas terapéuticas, entre otras causas por la adquisición de resistencia por parte de su agente etiológico dependiente de las características propias de cada especie (ej. manifestación clínica y distribución geográfica). Así, que comprender el mecanismo usado por el parásito para sobrevivir bajo la presión de tratamientos identificando probables blancos terapéuticos comunes y específicos es importante para el control de la leishmaniasis. Sin embargo, hasta el momento no se ha realizado un análisis donde se compare la expresión génica entre especies de Leishmania que exhiben diferentes características genéticas y biológicas reflejadas en las manifestaciones clínicas diferenciales asociadas. Aquí, aplicamos análisis comparativos de los perfiles transcriptómicos de líneas con resistencia inducida experimentalmente al antimonio trivalente (SbIII) de cinco especies de importancia médica (Subgénero L. (Leishmania): L. donovani, L. infantum y L. amazonensis; Subgénero L. (Viannia): L. panamensis y L. braziliensis), causantes de diferentes manifestaciones clínicas (que generalmente son Leishmaniasis cutánea para L. panamensis y L. amazonensis, mucocutánea para L. braziliensis y visceral para L. donovani y L. infantum) a partir de análisis funcionales de ontología y asignación de grupos ortólogos. Las líneas resistentes tenían respuestas diferenciales principalmente en procesos metabólicos, unión a compuestos y componentes membranales respecto a su contraparte sensible. Predominaron los genes ortólogos diferencialmente expresados asignados a las respuestas especie especificas con un total de 1426 genes propios. A nivel de la respuesta por subgénero no se encontraron genes compartidos entre las especies pertenecientes a L. (Leishmania) y solo 7 lo fueron entre aquellas pertenecientes a L. (Viannia). No se halló ningún gen diferencialmente expresado en común entre las 5 especies, pero se encontraron dos genes ortólogos sobrerregulados comunes entre 4 especies (L. donovani, L. braziliensis, L. amazonensis y L. panamensis) referidos a una proteína de unión a RNA y al complejo NAD(P)H citocromo B5 oxidorreductasa, asociados al control transcripcional y a la síntesis de novo del ácido linoleico, importantes en los mecanismos de resistencia a los antimoniales. Estos patrones obedecen probablemente el fenómeno multifactorial de la resistencia a drogas, dependiente de características intrínsecas del parásito y el entorno. Por ende, las aproximaciones especie específicas resultan más recomendables para la proposición de potenciales blancos terapéuticos.
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    Cambios en el bacteriana y eucariota intestinal en pacientes con blastocystis y clostridium difficile.
    (2020-01-22) Vega Romero, Laura Camila; Herrera Ossa, Giovanny Andres
    Dentro de los millones de microorganismos que componen la microbiota intestinal, Clostridium difficile y Blastocystis pueden tener un efecto modulador en diferentes maneras. El siguiente estudio tuvo como objetivo la descripción del bacterioma y eucarioma de cuatro grupos de pacientes: con coinfección por Blastocystis y C. difficile, infección únicamente por C. difficile, colonización únicamente por Blastocystis y pacientes libres de colonización/infección por estos microorganismos. Así mismo, se identificaron los subtipos de Blastocystis dentro de las muestras usando “amplicon sequencing” de los genes 16S-ARNr y 18S-ARNr. Los resultados obtenidos muestran que los subtipos más abundantes de Blastocystis fueron: ST1 (36,4%), ST3 (37,5%) y ST5 (19,3%). Aunque se ha propuesto que los ambientes de disbiosis previenen la colonización por Blastocystis, este estudio mostró una posible adaptación de Blastocystis a este escenario; gracias a los mecanismos de su hidrogenosoma y a los recursos que puede encontrar en este ambiente. De acuerdo con los resultados obtenidos, las diferencias significativas sobre la composición del bacterioma y eucarioma de los cuatro grupos se presentó sólo dentro de algunos géneros evaluados en el estudio. De esta manera, Blastocystis puede favorecer el aumento de poblaciones de bacterias benéficas de la microbiota, al cumplir con su rol predatorio. Lo anterior, ayudaría a esclarecer el estatus debatible de Blastocystis, inclinándose hacia la hipótesis de que podría ser un miembro benéfico para la microbiota intestinal. El presente estudio también brinda una visión holística sobre la competencia que existe entre los miembros de la microbiota bajo un escenario de disbiosis, especialmente en la competencia por recursos entre Blastocystis y algunos hongos. Este estudio contribuye al conocimiento de la composición de la microbiota y la interacciones de sus miembros.
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    Caracterización de comunidades bacterianas del chigüiro colombiano (Hydrochoerus hydrochaeris)
    (2024-03-20) Acevedo Ramírez, Valentina; Marín Sánchez, Jorge Arturo; Urbano, Plutarco; Ramírez González, Juan David; Muñoz, Marina; Muñoz Díaz, Marina; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) son la especie de roedores más grande del mundo, siendo nativos de Sudamérica. Esta especie exhibe una elevada importancia ecológica por sus aportes en la preservación de la biodiversidad y la salud de los ecosistemas donde habitan, además, tiene relevancia a nivel cultural y productivo (como fuente de alimento) en la región de los llanos colombianos. A pesar de esto, se desconoce la composición de las comunidades microbianas que puede transportar. El objetivo de este estudio fue caracterizar la composición de las comunidades bacterianas de chigüiros del Departamento del Casanare. Herramientas de biología molecular, como la PCR, y de secuenciación de nueva generación (NGS) como Oxford Nanopore, fueron integradas para explorar la diversidad bacteriana mediante técnicas de secuenciación profunda del gen 16S-rRNA a partir de 84 muestras pareadas de sangre, hisopados bucales e hisopados anales colectadas en dos municipios del Departamento de Casanare, Colombia (Paz de Ariporo y La Trinidad). Los resultados del estudio indican que la microbiota de los chigüiros posee una predominancia de diferentes géneros como Lactobacillus en hisopados bucales, Xanthomonadales en hisopados anales y Bdellovibrionales en sangre. Además, se observó la presencia de Bacteroides en todos los tipos de muestras, los cuales se han descrito en diferentes trabajos por cumplir funciones cruciales en la digestión y el fortalecimiento del sistema inmunológico en mamíferos. No obstante, la detección de microorganismos patógenos con potencial zoonótico, como Bacillus, Clostridium y Enterobacterales, en todas las muestras y en los dos municipios, también indica que estas comunidades de bacterias representan un riesgo para la salud pública. Este estudio proporciona información acerca de la microbiota de chigüiros por primera vez en Colombia, generando una línea de base acerca del potencial impacto en salud pública. Los resultados destacan la necesidad de implementar medidas preventivas para contener la posible propagación de infecciones, asegurando tanto la salud de las poblaciones humanas como la preservación de los chigüiros.
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    Caracterización de la microbiota eucariota en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) del departamento de Casanare, Colombia
    (2024-03-22) Marín Sánchez, Jorge Arturo; Ramírez González, Juan David; Muñoz Díaz, Claudia Marina; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La investigación de la microbiota en organismos silvestres se vuelve crucial, especialmente con la creciente interacción humana. El desarrollo de las actividades antropogénicas resalta la importancia de comprender la composición de microorganismos eucariotas en hospederos y ambientes, dado su potencial como agentes patógenos y su riesgo para la salud. Este estudio se enfoca en la caracterización de microorganismos eucariotas en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) de Casanare, Colombia, utilizando 18 muestras pareadas de hisopados anales y bucales de individuos de los municipios de Trinidad y Paz de Ariporo. Se secuencio un fragmento del gen ribosomal 18S rRNA que abarcaba las regiones hipervariables V4 hasta un fragmento de V7. Utilizando la herramienta de asignación taxonómica Kraken2, se identificó la presencia de microorganismos como Lomentospora prolificans, Trypanosoma cruzi, Coccidioides posadasii, Eimeria necatrix, Fonsecaea pedrosoi, Fusarium oxysporum, Neurospora crassa, Penicillium rubens, Phytophthora palmivora, Sarcocystis neurona, entre otros. Se identificó una baja diversidad de especies con una alta dominancia de pocas unidades taxonómicas. La presencia de estos microorganismos en las muestras analizadas se atribuye a la interacción del chigüiro con agentes portadores externos y al entorno ambiental en el que estos animales habitan. Este enfoque taxonómico proporciona una comprensión profunda de las comunidades de eucariotas asociadas con los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) en la región, destacando organismos de alta relevancia para la salud animal y humana. Los hallazgos confirman el papel de estos roedores como posibles transmisores de organismos patógenos con potencial zoonótico y contribuye a la ecoepidemiología de organismos silvestres, especialmente de los chigüiros (H. hydrochaeris).
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    Caracterización de la microbiota intestinal de bovinos raza Holstein parasitados por Fasciola spp. en Cundinamarca y Boyacá, Colombia.
    (2021-01-30) Ramírez Hernández, Angie Lorena; Ramírez, Juan David
    La identificación de alteraciones en la composición de la microbiota intestinal asociada a la presencia de parásitos ha sido un foco de atención de investigaciones por su importancia en procesos fisiológicos y de productividad animal. Dentro del campo de las relaciones hospedero-parásito, muchos estudios han sugerido que los helmintos pueden incidir sobre la composición microbiana debido a su efecto inmunomodulador. La fascioliasis bovina es una helmintiasis ampliamente estudiada en el campo de la inmunología, pero con poca información en el campo de la investigación de interacciones hospedero-helminto, por lo que se desconoce su impacto sobre las comunidades microbianas. Por esta razón, este estudio se dirige a describir la composición de la microbiota intestinal de bovinos Holstein parasitados por Fasciola provenientes del altiplano cundiboyacense colombiano, a través de un enfoque de secuenciación de nueva generación de amplicones de los genes ARNr-16S para procariotas y ARNr-18S para eucariotas. Para esto, se recolectaron 65 muestras fecales de bovinos Holstein provenientes de plantas de beneficio animal. Encontramos reducción en la abundancia relativa de Bacteroidetes y Ascomycota en las muestras de bovinos infectadas con el parásito, así como disminución en abundancia relativa de taxones comensales asociados a procesos de fermentación y digestión. Adicionalmente, se encontraron correlaciones positivas entre microorganismos que presentaron reducciones en abundancias relativas en las muestras positivas para Fasciola, lo cual se asoció a pérdida de peso consistente con el fenotipo de un bovino infectado por este parásito. Por lo anterior, se concluyó que la infección por Fasciola disminuye la capacidad de digerir material vegetal como consecuencia de la reducción en la abundancia de taxones encargados de esta función. Estos hallazgos proveen una base para futuras investigaciones sobre el desarrollo de tratamientos dirigidos a la modulación de estas poblaciones microbianas implicadas en la infección.
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    Comparación de los perfiles de expresión génica de una cepa asociada a un presunto brote oral y un caso crónico de la enfermedad de Chagas
    (2023-07-14) Velandia González, Lina Sofia; Cruz Saavedra, Lissa; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Trypanosoma cruzi es el causante de la enfermedad de Chagas (CD). Los brotes orales de CD han aumentado en los últimos años, y las cepas causantes de estos se han asociado a una sintomatología aguda y mayor mortalidad. En estos brotes, el parásito expresa proteínas de familias multigénicas como la transialidasa gp82; no obstante, no se ha observado la remodelación transcriptómica que puede llevar a cabo un cepa asociada a Chagas oral. Por lo anterior, en este estudio se comparó la remodelación transcriptómica del parásito de una cepa aislada de un presunto brote oral (JJ21) y de una cepa aislada de caso crónico (MG) de CD en un modelo de infección de fibroblastos, a las 24 y 72 horas post-infección. Para ello, se analizó el transcriptoma de ambas cepas, y se evidenció los genes diferencialmente expresados (DEGs, por sus siglas en inglés), ontologías génicas y vías diferencialmente expresadas gracias a TriTrypDB y KAAS. Se encontró que en la cepa JJ21 a las 24 horas se subexpresaron DGF-1, GP63 y Ts, mientras que se sobreexpresaron las TsII, TsV, MASP y TcMUCII. A las 72 horas, en la cepa JJ21 se subexpresaron DGF-1, GP63 y TcMUCII, y que se sobreexpresaron las TcMUC. Adicionalmente, a las 72 horas de la cepa JJ21 se sobreexpresaron procesos catabólicos. De la misma manera, se reconstruyó la vía de los ribosomas para la cepa JJ21, lo que sugiere la expresión diferencial de transcritos de proteínas ribosómicas entre cepas. En conclusión, en la cepa presuntamente asociada a un brote oral se logró determinar que existe un cambio en la expresión diferencial asociada a transcritos de proteínas de ribosomas y de familias multigénicas de proteínas. Las diferencias encontradas son el primer paso para entender los cambios entre cepas con distintos mecanismos de infección a un nivel de remodelación transcriptómica.
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    Comparative genomics of Leishmania braziliensis promastigotes subjected to different temperatures
    (2019-01-17) Vásquez Carreño, Nubia Marcela; Ramírez, Juan David
    The leishmaniases are complex neglected diseases caused by the protozoan parasite Leishmania. Cutaneous leishmaniasis is the most common clinical manifestation around the world, and in the Americas the main aetiological agent is Leishmania braziliensis. In recent studies, chromosome and gene copy number variations (CNVs) have been highlighted as some mechanisms used by Leishmania species to adapt to environmental changes such as host change or drug pressure. However, no studies have described the impact of temperature shifts across the genome of Leishmania promastigotes and particularly in L. braziliensis. Therefore, we sequenced the genome (DNA-Seq) of L. braziliensis promastigotes from cultures subjected to three different temperatures, 24, 28, and 30°C; then, we analysed the aneuploidy, gene CNVs, SNPs and Indels compared with those at the control temperature (26°C). We found that the increase in temperature at 30°C had a negative effect on promastigotes proliferation; although, there were no changes in the somy, SNPs and Indels on the DNA among the three temperatures compared to the control. Only around 3% of the genes having significant copy number variation (CNVs) at each temperature showed some important genes for adaptation to temperature shifts. In conclusion, there is not a relevant genome response to the temperature shift in short-term, therefore the adaptation of this species to abiotic change could be occurring at transcriptome level. The ecological consequences are herein discussed.
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    Descripción de comunidades bacterianas en afluentes del río Bogotá usando un enfoque metagenómico
    (2022-05-20) Urrea Messa, Vanessa del Pilar; Muñoz, Marina; Ramírez, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La actividad antropogénica ha generado un impacto negativo en los ambientes acuáticos y en los organismos que viven en él. Para esto se determinó la calidad del agua de las muestras tomadas en los cuatro afluentes del río Bogotá implementando estrategias tradicionales con pruebas fisicoquímicas y microbiológicas. También, se determinó la composición de las comunidades microbianas presentes por medio de análisis metagenómicos y con estos resultados, se describió la presencia de marcadores moleculares de interés en salud circundantes. Nuestros resultados muestran como la comunidad bacteriana domina en las muestras, adicional, la descripción de los marcadores de resistencia a antibióticos y factores de virulencia da un acercamiento de cómo el agua está sirviendo como medio para la propagación de estos. Finalmente, este estudio permite generar información relevante acerca del estado actual de los puntos muestreados y marca un punto de inicio para continuar con próximas investigaciones.
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    Embargo
    Fire legacies persist for decades in the interactions of the root-associated microbiota of Puya goudotiana
    (2025-08-29) Rodríguez Lugo, Nataly Alejandra; Patiño, Luz Helena; Cáceres, Tatiana; Vega, Laura; Hantson, Stijn Erik R; Ramírez González, Juan David; Sánchez Andrade, Adriana; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    El fuego es un proceso ecológico que puede tener efectos a largo plazo en la estructura y el funcionamiento de los ecosistemas, incluidas las propiedades del suelo y las comunidades microbianas asociadas a las plantas. Esto también ocurre en los ecosistemas de páramo, donde el fuego actúa como una perturbación recurrente. En este ecosistema altoandino, la bromelia endémica Puya goudotiana ha demostrado una alta tolerancia a las temperaturas elevadas. Sin embargo, se desconoce el efecto del fuego sobre la microbiota asociada a las raíces de esta especie. Por lo tanto, evaluamos las comunidades bacterianas y fúngicas en muestras de raíces y suelo circundante de P. goudotiana a lo largo de una cronosecuencia de incendios (incendios en 2002, 1988 y un control sin fuego), utilizando secuenciación de última generación basada en amplicones dirigida a las regiones 16S y 18S rARN, junto con un análisis fisicoquímico de suelos. A largo plazo, el fuego promovió una mayor diversidad bacteriana, pero no tuvo un efecto significativo en las propiedades del suelo ni en la composición de las comunidades bacterianas y fúngicas en comparación con las áreas no quemadas. Además, las comunidades microbianas estaban altamente diferenciadas entre muestras de raíces y suelo circundante. Proteobacteria (~30 %) y Ascomycota (~55 %) fueron los filos más abundantes. No obstante, la conectividad de las redes microbianas aumentó con el fuego. Veinte años después de un incendio, las comunidades microbianas interactuaban de forma más negativa, mostrando patrones de dominancia de bacterias copiótrofas. Sin embargo, casi 40 años después del incendio, las redes mantenían interacciones mayoritariamente positivas entre hongos y bacterias, lo que difería del estado previo al incendio. Destacamos el papel de la severidad del fuego y el clima del páramo en la conformación de las propiedades del suelo y la composición microbiana. Futuros estudios deberían evaluar la funcionalidad microbiana e intervalos de incendios más cortos para comprender mejor la dinámica de recuperación tras incendios.
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    Identificación de especies del género Aedes (Diptera; Culicidae) y detección de infección por Arbovirus (CHIKV, DENV, MAYV, ZIKV) circulantes en tres municipios de Arauca, Colombia.
    (2020-03-07) Martínez Medina, David Fernando; Ramírez, Juan David; Hernandez, Diana Carolina
    La identificación de las especies de vectores y su infección natural mediante RT- PCR (reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa) son datos importantes para el control de la transmisión de las arbovirosis, lo cual se lleva a cabo principalmente en países como México y Brasil. Sin embargo, esta información para el oriente de Colombia es limitada. Por lo cual, el siguiente estudio tuvo como objetivo la identificación (morfológica y molecular) de las especies del genero Aedes presentes en tres municipios (Saravena, Arauquita y Tame) del departamento de Arauca, Colombia. Así como, la detección de la infección por arbovirus (Dengue, Chikungunya, Zika y Mayaro), mediante la amplificación del material genético por RT-PCR. Los resultados muestran la coexistencia de Ae. aegypti y Ae. albopictus en la zona urbana de los municipios de Saravena y Arauquita, donde los individuos se encontraron infectados por Dengue (DENV-1) y Chikungunya (CHIKV). El arbovirus con mayor frecuencia es el DENV-1 con una tasa de infección de 24,3% (27/111) para Ae. aegypti y 39,7% (23/58) para Ae. albopictus. Seguido por CHIKV con una tasa de infección de 1,8% (2/111) para Ae. aegypti y 6,9% (4/58) para Ae. albopictus. Se obtuvo un 4.5% (5/111) de infección mixta por DENV-1 y CHIKV en la especie Ae. aegypti y no se detectó infección por Zika (ZIKV) y Mayaro (MAYV). Finalmente, el presente estudio propone el procesamiento individual de los insectos y no por pools para la detección de los arbovirus dado que de esta manera se obtiene una tasa de infección más acertada y se logra evidenciar las infecciones mixtas.
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    Identificación de Trypanosoma spp. y Leishmania spp. en murciélagos del departamento de Casanare
    (2021-01-19) Zúñiga González, Maria Fernanda; Ramírez, Juan David; Hernandez, Diana Carolina
    Los murciélagos constituyen el 20% de las especies de mamíferos en la actualidad, su capacidad de dispersión y colonización de nuevos nichos ha permitido que estos vertebrados estén expuestos a diferentes protozoos, como especies de los géneros Trypanosoma y Leishmania. Existen pocos estudios que relacionen la co-infección de ambos géneros en los murciélagos, por lo que el objetivo de este trabajo fue detectar ADN de Trypanosoma y Leishmania en murciélagos procedentes del departamento de Casanare, Colombia y establecer la frecuencia de infección de ambos géneros. De los 172 murciélagos capturados, se encontraron 18 individuos correspondientes a las especies Phyllostomus hastatus, Myotis spp. y Carollia perspicillata, que presentaban ambos géneros Trypanosoma y Leishmania. El total de murciélagos infectados con Trypanosoma spp. fue de 63 y 20 para Leishmania spp.. Este estudio refuerza la importancia de los murciélagos como reservorios de dos kinetoplastidos causantes de enfermedades endémicas en Colombia.
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    Infección por Trypanosoma cruzi, unidades discretas de tipificación y preferencias alimenticias de Psammolestes arthuri (Reduviidae: Triatominae) colectados en el Este de Colombia
    (2018-02-01) Velásquez-Ortiz, Natalia; Hernández, Carolina; Herrera, Giovanny; Cruz-Saavedra, Lissa; Higuera, Adriana; Arias-Giraldo, Luisa M.; Urbano, Plutarco; Cuervo, Andrés; Teherán, Aníbal; Ramírez, Juan David; Ramírez, Juan David
    La enfermedad de Chagas es causada por el protozoo parasitario Trypanosoma cruzi, el cual es transmitido por triatominos de la familia Reduviidae. Psammolestes arthuri es un triatomino selvático que se alimenta de aves y se ha encontrado infectado con T. cruzi. En Colombia, Ps. arthuri se ha encontrado en las viviendas, de manera que es importante evaluar la presencia del parásito y de qué se están alimentando. Por tal razón, en el presente estudio evaluamos la presencia de T. cruzi y las fuentes alimenticias de Ps. arthuri como una primera aproximación para elucidar nuevos posibles escenarios de la tansmisión de T. cruzi en Colombia.
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    Phylogenetic relationships and evolutionary patterns of the genus Psammolestes (Hemiptera: Reduviidae)
    (2021-01-25) Alvarado Lopez, Mateo Andrés; Ramírez, Juan David; Salazar, Camilo; Salgado-Roa, Fabian Camilo; Hernandez, Diana Carolina
    La familia Reduviidae (Hemiptera: Heteroptera) se encuentra entre las familias más diversas de los verdaderos insectos. La evolución y las relaciones filogenéticas de las tribus Rhodniini y Triatomini (Triatominae) están bien estudiadas debido a su relevancia epidemiológica como vectores de Trypanosoma cruzi, el parásito que causa la enfermedad de Chagas. Rhodniini está compuesto por los géneros Rhodnius y Psammolestes, donde queda por estudiar la diversidad genética del segundo en comparación con Rhodnius, principal vector de T. cruzi. Por lo tanto, reunimos 92 muestras en total, 38 de Psammolestes arthuri en Colombia, 24 de Psammolestes tertius y 30 de coreodas de Psammolestes en Brasil. Usamos cinco nuevos loci nucleares: tRNA guanina (37) -N (1) metil transferasa (TRNA), proteína inducible por hormona juvenil putativa (PJH), proteína de ensamblaje de proteína de azufre de hierro citosólico probable Ciao 1 (CISP), lipoil sintasa, mitocondrial ( LSM) y proteína no caracterizada para la adhesión celular (UPCA), junto con dos loci previamente informados: 28S y CYTB, para representar las relaciones filogenéticas y los patrones evolutivos del género Psammolestes. Cuatro de las siete topologías de genes no eran consistentes con la topología concatenada, mientras que las otras tres eran concordantes, pero el patrón general es claro: Psammolestes es un grupo monofilético, corroborando hipótesis previamente sugeridas para el género. El análisis de agrupamiento junto con las estadísticas resumidas de genética de poblaciones dio como resultado la delimitación de tres poblaciones diferentes. Estos tres clusters corresponden a cada una de las especies de Psammolestes conocidas a priori -definidas por morfología, ecología y métodos citogenéticos- lo que sugiere que las poblaciones de cada una de las especies tienen una estructura genética bien sustentada. En general, nuestros resultados corroboraron la existencia de las tres especies de Psammolestes descritas anteriormente, 4 mostrando que probablemente divergieron en alopatría, bajo la influencia del escudo de Guyana y la cuenca del Amazonas como barreras para la dispersión.
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    Portraying the gut bacterial communities and blood feeding sources of triatomine bugs (Hemiptera : Reduviidae), vectors of Chagas disease
    (2019-02-05) Arias-Giraldo, Luisa M.; Muñoz, Claudia Marina; Hernández Castro, Diana Carolina; Herrera Ossa, Giovanny Andrés; Caicedo Garzón, Valentina; Velásquez-Ortiz, Natalia; Cantillo, Omar; Urbano, Plutarco; Ramírez, Juan David
    Se realizó una primera caracterización del bacterioma intestinal de triatominos capturados en condiciones naturales en Colombia dada la falta de información sobre este bacterioma y los cambios que puede tener cuando Trypanosoma cruzi está presente o la fuente alimenticia del insecto cambia
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    Spatial diversification of Panstrongylus geniculatus (Reduviidae : Triatominae) in Colombia
    (2019-02-05) Caicedo Garzón, Valentina; Ramírez, Juan David; Salazar, Camilo
    Presentamos la primera aproximación de diversidad genética, relaciones filogenéticas y estructura poblacional de Panstrongylus geniculatus en Colombia. Compilamos un amplio muestreo para construir una filogenia y estimar la estructura genética de las poblaciones encontradas.
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    Transcriptome profiles evaluation of Leishmania braziliensis promastigotes subjected to temperature shifts in vitro
    (2019-02-05) Ballesteros Chitiva, Nathalia; Ramírez, Juan David
    The increasing of the temperature is one of the principal consequences of the climate change, which affect human populations due of the emergence and re-emergency of infection diseases. The Leishmaniases are diseases cause by protozoans’ parasites of the genus Leishmania; these diseases are composed by different clinical manifestations, one of the most important in the New World is Cutaneous Leishmaniasis for which the most common causative species is Leishmania braziliensis. This species as the other members of the Trypanosomatidae family present a genomic plasticity and a particular gene expression regulation that allow to the parasites to adapt and response to several stimulus, for that reason the aim of this study is evaluate the transcriptome profiles of L. braziliensis promastigotes subjected to temperature shifts. To reach this aim the authors performed an RNA-Seq that permitted to find several genes associated with a direct response to the treatments; also, through the growth curves done the authors evidenced a decrease in the cell proliferation in all the temperatures tested, where the most affected was 30°C. The results obtained in this study demonstrated a fast response of L. braziliensis promastigotes to temperature shifts.
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    Variación geográfica de la microbiota en cuatro especies del género Heliconius (Lepidoptera: Nymphalidae) en Colombia
    (2021-01-18) Luna-Niño, Nicolás; Ramírez, Juan David; Salazar, Camilo
    Estudios en las mariposas del género de Heliconius (Lepidoptera: Nymphalidae) han permitido entender los mecanismos que promueven la especiación y adaptación en el neotrópico. Análisis de la microbiota en estos insectos reportan variaciones interespecíficas e intraespecíficas, las cuales no están asociadas directamente a la depredación de polen. Además, se desconoce si los ecosistemas geográficos donde cohabitan mariposas con diferentes anillos miméticos afectan la microbiota de estos individuo. Este estudio utilizó amplicon-based sequencing del gen ARNr-16S en 66 muestras que corresponden a 4 especies de distintas regiones biogeográficas de Colombia: Heliconius clysonymus (n = 4), Heliconius erato (n = 24), Heliconius melpomene (n = 19) y Heliconius cydno (n = 19). La microbiota de Heliconius está dominada por los géneros Commensalibacter, Enterococcus, Spiroplasma y Orbus, donde sus abundancias difieren entre especies y subespecies, las cuales habitan diferentes provincias biogeográficas de Colombia. También, las agrupaciones de la microbiota por especie no reflejan totalmente sus relaciones filogenéticas. A pesar de la amplia diversidad de especies y subespecies de Heliconius en Colombia, este estudio encontró que las abundancias de las comunidades de su microbiota varían a partir de las condiciones ambientales de los ecosistemas en los que habitan y no presentan un patrón especie-específico