Pregrado en Biología

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Examinando Pregrado en Biología por Título

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    A test of spatial proximity as driver for social bond formation
    (2023-03-06) Cardona-Restrepo, Manuela Cardona; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    La proximidad espacial es un factor que puede promover la formación de relaciones sociales. En esta investigación plantee un experimento en el que se evaluó si la proximidad espacial puede promover la formación de relaciones sociales de bajo costo, y favorecer la formación de relaciones de cooperación (relaciones de alto costo). Para esto se usaron 23 curíes divididos en grupos de cuatro individuos en seis encierros diferentes, en los cuales controlé la familiaridad entre ellos. El experimento consistió en tres tratamientos que fueron evaluados en tres fases. En el tratamiento A los individuos podían interactuar libremente, En el tratamiento B los individuos fueron forzados a compartir un espacio y en el control, los individuos no tenían oportunidad de compartir. Los resultados sugieren que la proximidad espacial promueve la formación de relaciones sociales. Este fenómeno es más evidente cuando los individuos pueden decidir libremente si compartir el espacio con otros. Adicionalmente, las parejas de individuos que forman relaciones de forrajeo tienen mayor opción de desarrollar relaciones de alto costo. En conclusión, la proximidad espacial, especialmente la voluntaria, promueve la formación de relaciones sociales de bajo costo, y estas a su vez favorecen la formación de relaciones de cooperación.
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    Análisis comparativo de las respuestas transcripcionales de cinco especies de Leishmania frente al antimonio trivalente.
    (2021-01-25) Medina Velasquez, Julián Esteban; Ramírez González, Juan David
    La leishmaniasis es considerada una enfermedad tropical desatendida para la cual no se cuenta con una vacuna. Por otra parte, las drogas de primera elección han presentado un aumento en las fallas terapéuticas, entre otras causas por la adquisición de resistencia por parte de su agente etiológico dependiente de las características propias de cada especie (ej. manifestación clínica y distribución geográfica). Así, que comprender el mecanismo usado por el parásito para sobrevivir bajo la presión de tratamientos identificando probables blancos terapéuticos comunes y específicos es importante para el control de la leishmaniasis. Sin embargo, hasta el momento no se ha realizado un análisis donde se compare la expresión génica entre especies de Leishmania que exhiben diferentes características genéticas y biológicas reflejadas en las manifestaciones clínicas diferenciales asociadas. Aquí, aplicamos análisis comparativos de los perfiles transcriptómicos de líneas con resistencia inducida experimentalmente al antimonio trivalente (SbIII) de cinco especies de importancia médica (Subgénero L. (Leishmania): L. donovani, L. infantum y L. amazonensis; Subgénero L. (Viannia): L. panamensis y L. braziliensis), causantes de diferentes manifestaciones clínicas (que generalmente son Leishmaniasis cutánea para L. panamensis y L. amazonensis, mucocutánea para L. braziliensis y visceral para L. donovani y L. infantum) a partir de análisis funcionales de ontología y asignación de grupos ortólogos. Las líneas resistentes tenían respuestas diferenciales principalmente en procesos metabólicos, unión a compuestos y componentes membranales respecto a su contraparte sensible. Predominaron los genes ortólogos diferencialmente expresados asignados a las respuestas especie especificas con un total de 1426 genes propios. A nivel de la respuesta por subgénero no se encontraron genes compartidos entre las especies pertenecientes a L. (Leishmania) y solo 7 lo fueron entre aquellas pertenecientes a L. (Viannia). No se halló ningún gen diferencialmente expresado en común entre las 5 especies, pero se encontraron dos genes ortólogos sobrerregulados comunes entre 4 especies (L. donovani, L. braziliensis, L. amazonensis y L. panamensis) referidos a una proteína de unión a RNA y al complejo NAD(P)H citocromo B5 oxidorreductasa, asociados al control transcripcional y a la síntesis de novo del ácido linoleico, importantes en los mecanismos de resistencia a los antimoniales. Estos patrones obedecen probablemente el fenómeno multifactorial de la resistencia a drogas, dependiente de características intrínsecas del parásito y el entorno. Por ende, las aproximaciones especie específicas resultan más recomendables para la proposición de potenciales blancos terapéuticos.
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    Análisis de la frecuencia de detección de Clostridium paraputrificum y los potenciales cambios en la composición de comunidades bacterianas en muestras de heces de animales de granja y domésticos
    (2023-08-22) De La Cruz Bermúdez, Emanuella; Muñoz Díaz, Claudia Marina; Camargo Mancipe, Anny
    Clostridium paraputrificum es una bacteria anaerobia Gram-positiva, móvil y formadora de esporas que causa infecciones pediátricas, enterocolitis y bacteriemia en pacientes inmunocomprometidos. En animales puede causar lesiones quitinolíticas e intestinales relacionadas con quistes gaseosos, gangrena gaseosa y enterocolitis necrotizante. La relevancia clínica ha sido poco descrita, aun cuando los reportes de caso de aislamientos de esta bacteria se asocian con infecciones graves en humanos y animales. En Colombia, se ha descrito el genoma y los factores de virulencia codificantes por C. paraputrificum en un grupo reducido de aislamiento obtenidos de humanos, pero no se ha estudiado la frecuencia de infección en humanos o animales, ni los cambios en la composición de la microbiota en presencia de este Clostridial. Debido a esto, en este estudio se determinó la frecuencia de circulación de C. paraputrifium en 302 muestras de heces de caninos, felinos y animales de granja del departamento de Boyacá y la ciudad de Bogotá, Cundinamarca usando Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR). Adicionalmente, se evaluó la composición de las comunidades microbianas en un subconjunto de muestras que incluyó individuos positivos y negativos para esta especie bacteriana en proporción 2:1, respectivamente. Para esto, se realizó secuenciación profunda del 16S-ARNr por la plataforma MinION (Oxford Nanopore Technologies). La frecuencia de detección global fue de C. paraputrificum en las muestras (C.par+) fue del 8% (n=24). Se encontró que la frecuencia de detección C.par+ en caninos fue del 30% (n=12), en felinos fue 6.5% (n=8), en caprinos fue 10% (n=2), en porcinos fue 2.5% (n=1) y en bovinos fue 2.5% (n=1). Una vez normalizadas las muestras y de acuerdo con la cantidad de lecturas obtenidas, se incluyeron 18 muestras C. par+ de caninos (n=9), caprinos (n=2) y felinos (n=7). El análisis de las comunidades bacterianas evidenció predominancia de los fila Proteobacteria, Bacteroidetes y Firmicutes en los tres grupos de animales. No obstante, los fila Tenericutes, Actinobacteria y Kiritimatiellaeota no fueron predominantes en las muestras la abundancia relativa de estos fue mayor en caprinos en comparación con los caninos y felinos. En los caninos y felinos los principales miembros diferencialmente abundantes fueron Faecalibacterium, Bacteroides y Bifidobacterium, mientras que, entre los caprinos, los principales miembros diferencialmente abundantes con los cuales se relacionó fueron Ruminococcaceae UCG-014, Alistipes y Escherichia-Shigella. Este estudio permitió ampliar el panorama de las diferencias en la frecuencia de detección de C. paraputrificum entre animales y su potencial relevancia en la composición de la microbiota.
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    Assessment of same-sex and opposite-sex partner preferences in guinea pigs (Cavia porcellus)
    (2024-03-19) Romero Chacón, Ana María; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    Las relaciones sociales selectivas son relaciones no fundamentales que se dan en las especies que viven en grupo, probablemente debido a los beneficios que conllevan. La preferencia de pareja son las relaciones sociales selectivas para individuos familiares y se ha evidenciado en diferentes especies a lo largo del reino animal. En este estudio, evalué la preferencia de pareja en relaciones sociales entre hembras del mismo sexo y de sexo opuesto en cobayas (Cavia porcellus). Utilicé un test de preferencia de pareja con un aparato experimental de tres cámaras en el que el individuo focal puede interactuar libremente y elegir entre un individuo familiar, uno nuevo o ninguno de ellos. Mis resultados mostraron una alta socialidad y preferencia por una pareja conocida en relaciones de sexo opuesto. La preferencia de pareja parece estar determinada por las condiciones ecológicas y sociales a las que está expuesta la especie más que a un contexto evolutivo.
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    Cambios en el bacteriana y eucariota intestinal en pacientes con blastocystis y clostridium difficile.
    (2020-01-22) Vega Romero, Laura Camila; Ramírez González, Juan David
    Dentro de los millones de microorganismos que componen la microbiota intestinal, Clostridium difficile y Blastocystis pueden tener un efecto modulador en diferentes maneras. El siguiente estudio tuvo como objetivo la descripción del bacterioma y eucarioma de cuatro grupos de pacientes: con coinfección por Blastocystis y C. difficile, infección únicamente por C. difficile, colonización únicamente por Blastocystis y pacientes libres de colonización/infección por estos microorganismos. Así mismo, se identificaron los subtipos de Blastocystis dentro de las muestras usando “amplicon sequencing” de los genes 16S-ARNr y 18S-ARNr. Los resultados obtenidos muestran que los subtipos más abundantes de Blastocystis fueron: ST1 (36,4%), ST3 (37,5%) y ST5 (19,3%). Aunque se ha propuesto que los ambientes de disbiosis previenen la colonización por Blastocystis, este estudio mostró una posible adaptación de Blastocystis a este escenario; gracias a los mecanismos de su hidrogenosoma y a los recursos que puede encontrar en este ambiente. De acuerdo con los resultados obtenidos, las diferencias significativas sobre la composición del bacterioma y eucarioma de los cuatro grupos se presentó sólo dentro de algunos géneros evaluados en el estudio. De esta manera, Blastocystis puede favorecer el aumento de poblaciones de bacterias benéficas de la microbiota, al cumplir con su rol predatorio. Lo anterior, ayudaría a esclarecer el estatus debatible de Blastocystis, inclinándose hacia la hipótesis de que podría ser un miembro benéfico para la microbiota intestinal. El presente estudio también brinda una visión holística sobre la competencia que existe entre los miembros de la microbiota bajo un escenario de disbiosis, especialmente en la competencia por recursos entre Blastocystis y algunos hongos. Este estudio contribuye al conocimiento de la composición de la microbiota y la interacciones de sus miembros.
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    Caracterización de comunidades bacterianas del chigüiro colombiano (Hydrochoerus hydrochaeris)
    (2024-03-20) Acevedo Ramírez, Valentina; Marín Sánchez, Jorge Arturo; Urbano, Plutarco; Ramírez González, Juan David; Muñoz, Marina; Muñoz Díaz, Claudia Marina; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) son la especie de roedores más grande del mundo, siendo nativos de Sudamérica. Esta especie exhibe una elevada importancia ecológica por sus aportes en la preservación de la biodiversidad y la salud de los ecosistemas donde habitan, además, tiene relevancia a nivel cultural y productivo (como fuente de alimento) en la región de los llanos colombianos. A pesar de esto, se desconoce la composición de las comunidades microbianas que puede transportar. El objetivo de este estudio fue caracterizar la composición de las comunidades bacterianas de chigüiros del Departamento del Casanare. Herramientas de biología molecular, como la PCR, y de secuenciación de nueva generación (NGS) como Oxford Nanopore, fueron integradas para explorar la diversidad bacteriana mediante técnicas de secuenciación profunda del gen 16S-rRNA a partir de 84 muestras pareadas de sangre, hisopados bucales e hisopados anales colectadas en dos municipios del Departamento de Casanare, Colombia (Paz de Ariporo y La Trinidad). Los resultados del estudio indican que la microbiota de los chigüiros posee una predominancia de diferentes géneros como Lactobacillus en hisopados bucales, Xanthomonadales en hisopados anales y Bdellovibrionales en sangre. Además, se observó la presencia de Bacteroides en todos los tipos de muestras, los cuales se han descrito en diferentes trabajos por cumplir funciones cruciales en la digestión y el fortalecimiento del sistema inmunológico en mamíferos. No obstante, la detección de microorganismos patógenos con potencial zoonótico, como Bacillus, Clostridium y Enterobacterales, en todas las muestras y en los dos municipios, también indica que estas comunidades de bacterias representan un riesgo para la salud pública. Este estudio proporciona información acerca de la microbiota de chigüiros por primera vez en Colombia, generando una línea de base acerca del potencial impacto en salud pública. Los resultados destacan la necesidad de implementar medidas preventivas para contener la posible propagación de infecciones, asegurando tanto la salud de las poblaciones humanas como la preservación de los chigüiros.
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    Caracterización de la microbiota eucariota en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) del departamento de Casanare, Colombia
    (2024-03-22) Marín Sánchez, Jorge Arturo; Ramírez González, Juan David; Muñoz Díaz, Claudia Marina; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La investigación de la microbiota en organismos silvestres se vuelve crucial, especialmente con la creciente interacción humana. El desarrollo de las actividades antropogénicas resalta la importancia de comprender la composición de microorganismos eucariotas en hospederos y ambientes, dado su potencial como agentes patógenos y su riesgo para la salud. Este estudio se enfoca en la caracterización de microorganismos eucariotas en chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) de Casanare, Colombia, utilizando 18 muestras pareadas de hisopados anales y bucales de individuos de los municipios de Trinidad y Paz de Ariporo. Se secuencio un fragmento del gen ribosomal 18S rRNA que abarcaba las regiones hipervariables V4 hasta un fragmento de V7. Utilizando la herramienta de asignación taxonómica Kraken2, se identificó la presencia de microorganismos como Lomentospora prolificans, Trypanosoma cruzi, Coccidioides posadasii, Eimeria necatrix, Fonsecaea pedrosoi, Fusarium oxysporum, Neurospora crassa, Penicillium rubens, Phytophthora palmivora, Sarcocystis neurona, entre otros. Se identificó una baja diversidad de especies con una alta dominancia de pocas unidades taxonómicas. La presencia de estos microorganismos en las muestras analizadas se atribuye a la interacción del chigüiro con agentes portadores externos y al entorno ambiental en el que estos animales habitan. Este enfoque taxonómico proporciona una comprensión profunda de las comunidades de eucariotas asociadas con los chigüiros (Hydrochoerus hydrochaeris) en la región, destacando organismos de alta relevancia para la salud animal y humana. Los hallazgos confirman el papel de estos roedores como posibles transmisores de organismos patógenos con potencial zoonótico y contribuye a la ecoepidemiología de organismos silvestres, especialmente de los chigüiros (H. hydrochaeris).
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    Caracterización de la microbiota intestinal de bovinos raza Holstein parasitados por Fasciola spp. en Cundinamarca y Boyacá, Colombia.
    (2021-01-30) Ramírez Hernández, Angie Lorena; Ramírez González, Juan David
    La identificación de alteraciones en la composición de la microbiota intestinal asociada a la presencia de parásitos ha sido un foco de atención de investigaciones por su importancia en procesos fisiológicos y de productividad animal. Dentro del campo de las relaciones hospedero-parásito, muchos estudios han sugerido que los helmintos pueden incidir sobre la composición microbiana debido a su efecto inmunomodulador. La fascioliasis bovina es una helmintiasis ampliamente estudiada en el campo de la inmunología, pero con poca información en el campo de la investigación de interacciones hospedero-helminto, por lo que se desconoce su impacto sobre las comunidades microbianas. Por esta razón, este estudio se dirige a describir la composición de la microbiota intestinal de bovinos Holstein parasitados por Fasciola provenientes del altiplano cundiboyacense colombiano, a través de un enfoque de secuenciación de nueva generación de amplicones de los genes ARNr-16S para procariotas y ARNr-18S para eucariotas. Para esto, se recolectaron 65 muestras fecales de bovinos Holstein provenientes de plantas de beneficio animal. Encontramos reducción en la abundancia relativa de Bacteroidetes y Ascomycota en las muestras de bovinos infectadas con el parásito, así como disminución en abundancia relativa de taxones comensales asociados a procesos de fermentación y digestión. Adicionalmente, se encontraron correlaciones positivas entre microorganismos que presentaron reducciones en abundancias relativas en las muestras positivas para Fasciola, lo cual se asoció a pérdida de peso consistente con el fenotipo de un bovino infectado por este parásito. Por lo anterior, se concluyó que la infección por Fasciola disminuye la capacidad de digerir material vegetal como consecuencia de la reducción en la abundancia de taxones encargados de esta función. Estos hallazgos proveen una base para futuras investigaciones sobre el desarrollo de tratamientos dirigidos a la modulación de estas poblaciones microbianas implicadas en la infección.
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    Caracterización del transcriptoma de la araña polimórfica de color Gasteracantha cacriformis, con enfoque a los genes de pigmento
    (2020-07-24) Torres Quintero, Paula Alexandra; Pardo Díaz, Geimy Carolina
    El polimorfismo de coloración es un sistema útil para estudiar procesos evolutivos y de desarrollo. No obstante, el estudio de este rasgo se ha sesgado a organismos modelo y la coloración en arácnidos no ha sido bien estudiada. La araña Gasteracantha cancriformis es una especie neotropical que presenta polimorfismo de coloración abdominal con al menos 16 morfos conocidos distribuidos desde el sur de Estados Unidos hasta el norte de Argentina. A la fecha, las bases genéticas que controlan dicho polimorfismo son desconocidas. En este estudio implementé RNAseq para ensamblar el transcriptoma de Gasteracantha, y evaluar expresión génica diferencial asociada a la coloración en hembras de color blanco, amarillo y naranja. A partir de las secuencias de los transcritos hice análisis nucleotídicos y estadísticos para establecer si existe una relación entre coloración y polimorfismos de ADN (SNPs) en el transcriptoma. En general, el perfil de expresión génica fue similar entre los fenotipos amarillo y naranja, quienes difirieron del fenotipo blanco. En los morfos amarillo y naranja dectecté mayor expresión de genes relacionados a astacina y vitelogenina, lo cual sugiere que estas coloraciones en G. cancriformis son producto de carotenoides. A nivel nucleotídico encontré que los transcritos diferencialmente expresados muestran señal asociada a fenotipo de color, pero esto no sucede a nivel de transcriptoma completo. Los datos obtenidos en este estudio proporcionan un recurso genético valioso para futuras investigaciones en arañas neotropicales y constituyen un paso fundamental hacia la identificación de las bases genéticas del polimorfismo de color en estos animales.
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    Caracterización genómica de especies de Clostridiales Circulantes en el río Pasto
    (2024-08-22) Fernández Sánchez, Juan Diego; Muñoz Díaz, Claudia Marina; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La clase Clostridia está compuesta por bacterias con diversos roles potenciales, contando con especies comensales y otras patógenos oportunistas. Estas bacterias son clasificadas como anaerobias y están presentes a nivel intestinal de humanos y animales; sin embargo, la alta resistencia de sus esporas al oxígeno les permite ampliar su rango de dispersión, siendo encontrados en muestras ambientales de suelos y aguas. La presencia de este tipo de microorganismos en cuerpos de agua puede ser un marcador de pérdida de su calidad. Zonas en las que es frecuente el contacto entre poblaciones humanas y cuerpos hídricos pueden ser propensas a contaminación de diferentes tipos, siendo una de ellas los microorganismos, muchos de los cuales son de importancia clínica por su potencial patógeno. Este estudio tuvo como objetivo detectar y caracterizar a nivel genómico bacterias Clostridiales aisladas de muestras de agua, tomadas entre septiembre del 2022 hasta marzo del 2023 del Río Pasto. Para el proceso de caracterización se ensamblaron Genomas Metagenómicos Ensamblados (MAGs) en los cuales se identificaron marcadores de resistencia a antimicrobianos y factores de virulencia, siendo esto tema relevante de salud pública. Se ensamblaron 33 MAGs de alta calidad y cuatro de calidad media, correspondientes a 11 especies clostridiales, estando entre estas Clostridium perfringens, Clostridium tetani, Clostridium botulinum y Clostridioides difficile, que son medicamente relevantes. Pymaiobacter missiliensis y Clostridium sulfidigenes también fueron detectadas en este estudio, siendo especies Clostridiales recientemente descritas y poco estudiadas, por lo que no es claro su impacto sobre hospederos. La búsqueda de factores de virulencia a partir de los MAGs mostró la presencia de genes nag, junto con otros genes de este tipo frecuentes en C. perfringens. Adicionalmente, se encontraron marcadores de resistencia a antibióticos, especialmente asociados a resistencia a fluoroquinolonas, aminoglucósidos, lincosamidas, péptidos y tetraciclinas, ampliamente distribuidos en los MAGs obtenidos. En este estudio se identificó la presencia de 11 especies Clostridiales en cuerpos de agua, las cuales transportan factores de virulencia y marcadores de resistencia, revelando un riesgo microbiológico en el río Pasto.
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    Embargo
    Cardiac dynamics in the invasive snail Cornu aspersum (Müller, 1774)
    (2025-07-31) Pardo Sarmiento, Edgar Alejandro; Hernández, Juan P.; Buitrago Ricaurte, Natalia; Riveros Rivera, André Josafat; Riveros Rivera, André Josafat; Hernández, Juan Pablo; Buitrago Ricaurte, Natalia; CANNON
    La función cardíaca está estrechamente relacionada con la actividad metabólica y es fundamental para el transporte de oxígeno y sustratos metabólicos en vertebrados e invertebrados durante la actividad locomotora. Sin embargo, en Cornu aspersum, la dinámica cardíaca durante la actividad física no se ha evaluado previamente. En este estudio, investigamos la relación entre los parámetros morfométricos, el estado fisiológico, la anatomía y la dinámica cardíaca mediante el desarrollo de un método novedoso y automatizado basado en la actividad ventricular sistólica de caracoles inmovilizados y en movimiento. Encontramos que los parámetros morfométricos no influyeron significativamente en la dinámica cardíaca, mientras que actividad física aumentó la frecuencia cardíaca y no alteró sustancialmente la variabilidad ventricular sistólica. Nuestros resultados sugieren que la actividad física modula la frecuencia cardíaca independientemente del tamaño corporal, lo que implica la participación de moduladores cardiovasculares internos y externos que facilitan la adaptación fisiológica a los ambientes terrestres. Nuestro estudio no solo introduce nuevas herramientas para la monitorización cardíaca en caracoles terrestres, sino que también destaca la importancia de investigar los mecanismos subyacentes a la plasticidad cardiovascular, fomentando investigaciones futuras sobre el papel del sistema cardiovascular en la adaptación ecológica.
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    Acceso Abierto
    Characterization of the sexual dimorphism in oilbirds (Steatornis caripensis)
    (2022-08) Robayo Salek, Andrés Felipe; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    The extent to which males and females of monomorphic species differ from each other is still an ecological and evolutionary puzzle. In these species it has been proposed that slight differences in selection pressures can result in phenotypic differences between sexes. However, such differences may be very subtle or may be exhibited in traits that are not perceived by humans, such as coloration. For example, in blue tits (Cyanistes caeruleus) males differ from females in the UV reflection of the crown patch. Here, I aimed to identify the morphological differences between sexes in a monomorphic specie, the oilbird (Steatornis caripensis). In this species, males are slightly larger and grayish than females, making it difficult to determine the sex of individuals by means other than molecular sexing, an invasive technique. To characterize phenotypic differences between males and females, I measured five morphological traits on 75 museum individuals and 16 wild individuals, and the feather coloration in 33 museum individuals and 11 wild individuals. I used these measures to quantify the degree of sexual dimorphism and identify the traits that differentiate males from females. I found that S. caripensis is mostly monomorphic showing subtle differences in the width and the length of the bill, which is larger in males compared to females. I also found subtle differences in plumage coloration suggesting that color may play an important role in the differentiation of the sexes, and possibly in mate choice. My results indicate that despite the slight differences in beak shape between males and females, the sexes in oilbirds seem to be indistinguishable.
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    Coevolución entre Heliconius y Passiflora: una búsqueda de evidencia desde su distribución geográfica y riqueza de especies
    (2021-09-01) Sánchez Melo, Catalina Sofía; Salazar Clavijo, Camilo Andrés; Rueda, Nicol; Genética Evolutiva, Filogeografía y Ecología de Biodiversidad Neotropical
    La diversificación adaptativa de las plantas y sus insectos herbívoros podría estar influenciada por procesos de coevolución. La relación biótica entre las mariposas Heliconius y sus plantas hospederas Passiflora ha sido estudiada desde sus aspectos morfológicos, fisiológicos y de comportamiento. Sin embargo, no se ha estudiado si el grado de correlación geográfica entre sus distribuciones y riqueza es informativo respecto a su coevolución. Para esto, se modeló la riqueza y distribución de 165 especies de Passiflora y 34 de Heliconius en Colombia usando cuatro algoritmos diferentes. En ambos análisis se identificó la variable ambiental que mejor explica los patrones observados. Se comparó el patrón de distribución entre una especie monófoga H.eleuchia y sus plantas huésped y una olífaga H.cydno con sus 28 plantas huésped. El grado de solapamiento de Passiflora y Heliconius es bajo y está explicado por variables ambientales distintas –isotermalidad y estacionalidad de la precipitación, respectivamente–. Sin embargo, la variable más importante para la distribución de ambos grupos es el rango de temperatura anual. La distribución de H.eleuchia tiene una correlación más alta con sus plantas hospederas que la distribución de H.cydno, lo que es consistente con la monofagia y oligofagia de sus larvas, respectivamente. Otros factores ecológicos como la toxicidad merecen mayor atención como posibles factores que conllevan a coevolución. A escala geográfica se puede concluir que es probable que el patrón de diversificación de ambos géneros sea distinto ya que no comparten centros de riqueza y, por ende, no se trate de coevolución estricta.
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    Comparación de los perfiles de expresión génica de una cepa asociada a un presunto brote oral y un caso crónico de la enfermedad de Chagas
    (2023-07-14) Velandia González, Lina Sofia; Cruz Saavedra, Lissa; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    Trypanosoma cruzi es el causante de la enfermedad de Chagas (CD). Los brotes orales de CD han aumentado en los últimos años, y las cepas causantes de estos se han asociado a una sintomatología aguda y mayor mortalidad. En estos brotes, el parásito expresa proteínas de familias multigénicas como la transialidasa gp82; no obstante, no se ha observado la remodelación transcriptómica que puede llevar a cabo un cepa asociada a Chagas oral. Por lo anterior, en este estudio se comparó la remodelación transcriptómica del parásito de una cepa aislada de un presunto brote oral (JJ21) y de una cepa aislada de caso crónico (MG) de CD en un modelo de infección de fibroblastos, a las 24 y 72 horas post-infección. Para ello, se analizó el transcriptoma de ambas cepas, y se evidenció los genes diferencialmente expresados (DEGs, por sus siglas en inglés), ontologías génicas y vías diferencialmente expresadas gracias a TriTrypDB y KAAS. Se encontró que en la cepa JJ21 a las 24 horas se subexpresaron DGF-1, GP63 y Ts, mientras que se sobreexpresaron las TsII, TsV, MASP y TcMUCII. A las 72 horas, en la cepa JJ21 se subexpresaron DGF-1, GP63 y TcMUCII, y que se sobreexpresaron las TcMUC. Adicionalmente, a las 72 horas de la cepa JJ21 se sobreexpresaron procesos catabólicos. De la misma manera, se reconstruyó la vía de los ribosomas para la cepa JJ21, lo que sugiere la expresión diferencial de transcritos de proteínas ribosómicas entre cepas. En conclusión, en la cepa presuntamente asociada a un brote oral se logró determinar que existe un cambio en la expresión diferencial asociada a transcritos de proteínas de ribosomas y de familias multigénicas de proteínas. Las diferencias encontradas son el primer paso para entender los cambios entre cepas con distintos mecanismos de infección a un nivel de remodelación transcriptómica.
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    Comparative genomics of Leishmania braziliensis promastigotes subjected to different temperatures
    (2019-01-17) Vásquez Carreño, Nubia Marcela; Ramírez González, Juan David
    The leishmaniases are complex neglected diseases caused by the protozoan parasite Leishmania. Cutaneous leishmaniasis is the most common clinical manifestation around the world, and in the Americas the main aetiological agent is Leishmania braziliensis. In recent studies, chromosome and gene copy number variations (CNVs) have been highlighted as some mechanisms used by Leishmania species to adapt to environmental changes such as host change or drug pressure. However, no studies have described the impact of temperature shifts across the genome of Leishmania promastigotes and particularly in L. braziliensis. Therefore, we sequenced the genome (DNA-Seq) of L. braziliensis promastigotes from cultures subjected to three different temperatures, 24, 28, and 30°C; then, we analysed the aneuploidy, gene CNVs, SNPs and Indels compared with those at the control temperature (26°C). We found that the increase in temperature at 30°C had a negative effect on promastigotes proliferation; although, there were no changes in the somy, SNPs and Indels on the DNA among the three temperatures compared to the control. Only around 3% of the genes having significant copy number variation (CNVs) at each temperature showed some important genes for adaptation to temperature shifts. In conclusion, there is not a relevant genome response to the temperature shift in short-term, therefore the adaptation of this species to abiotic change could be occurring at transcriptome level. The ecological consequences are herein discussed.
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    Cuesta arriba: integración de rutas en tres dimensiones por la hormiga arriera, Atta colombica
    (2021-01-27) Cardona Hurtado, David; Riveros Rivera, André Josafat; Srygley, Robert B
    La integración de rutas es una estrategia de navegación ampliamente usada por muchos animales que les permite retornar a un punto de partida, mediante el procesamiento de información angular y de distancia. A pesar de que la integración de rutas está bien establecida en el plano bidimensional (2D) aún no se entiende muy bien si se extiende a la tercera dimensión (3D). Aquí investigamos si A. colombica tiene la capacidad de calcular vectores en 3D mediante el uso de diferentes experimentos en los que se modifica la inclinación y la distancia de diferentes recorridos. Los resultados indican que A. colombica es capaz de percibir los cambios en la dirección e inclinación de sus rutas e incorpora dicha información angular al integrador de rutas con las distancias al suelo correspondientes; mostrando una mejor habilidad para hacerlo en las configuraciones 3D. Estos resultados sugieren una posible representación tridimensional de su mundo, sumada a lo que podría ser una representación neural del espacio mucho más tolerante al ruido del procesamiento de la entrada y salida de información.
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    Descripción de comunidades bacterianas en afluentes del río Bogotá usando un enfoque metagenómico
    (2022-05-20) Urrea Messa, Vanessa del Pilar; Muñoz, Marina; Ramírez González, Juan David; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    La actividad antropogénica ha generado un impacto negativo en los ambientes acuáticos y en los organismos que viven en él. Para esto se determinó la calidad del agua de las muestras tomadas en los cuatro afluentes del río Bogotá implementando estrategias tradicionales con pruebas fisicoquímicas y microbiológicas. También, se determinó la composición de las comunidades microbianas presentes por medio de análisis metagenómicos y con estos resultados, se describió la presencia de marcadores moleculares de interés en salud circundantes. Nuestros resultados muestran como la comunidad bacteriana domina en las muestras, adicional, la descripción de los marcadores de resistencia a antibióticos y factores de virulencia da un acercamiento de cómo el agua está sirviendo como medio para la propagación de estos. Finalmente, este estudio permite generar información relevante acerca del estado actual de los puntos muestreados y marca un punto de inicio para continuar con próximas investigaciones.
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    Acceso Abierto
    Description and phylogenetic inferences of a new fossil turtle from the Miocene of Colombia
    (2024-08-26) Leal Amaya, David Esteban; Cadena Rueda, Edwin Alberto; Paleontología Neotropical Tradicional y Molecular
    Describo una nueva tortuga fósil del Mioceno (Serravallian) del desierto de La Tatacoa en Colombia, que he identificado como una nueva especie de la familia Podocnemididae. Una concha articulada y un cráneo (VPPLT-1730) y una concha articulada (VPPLT-1721) se encuentran entre los especímenes. Las características de estos fósiles incluyen un amplio margen anterior con muescas laterales, un escudete gular que separa completamente los húmeros y está en contacto con las pectorales, y un escudete vertebral 1 que solo se superpone al hueso nucal. Debido a estos rasgos, pude determinar que estos especímenes pertenecen a un nuevo género y especie de la familia Podocnemididae. De acuerdo con el análisis filogenético, este nuevo taxón está estrechamente relacionado con otros miembros de Podocnemididae, la futura descripción completa y el estudio del nuevo género y especie podrían aportar nuevos conocimientos sobre la evolución y la paleodiversidad de los podocnemídidos en América del Sur.
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    Divergencia por los Andes: vicarianza en las poblaciones de Ancylometes bogotensis (Araneae: Ctenidae)
    (2019-06-07) Gámez Vargas, Andrés Felipe; Salazar, Camilo; Salgado Roa, Fabian Camilo
    La compleja topografía de los Andes ha facilitado múltiples eventos de diversificación promoviendo la diversidad de linajes en Suramérica. Sin embargo, poco se conoce sobre la divergencia causada por los Andes en artrópodos y en particular en arácnidos. En este estudio se evaluó la conectividad genética de poblaciones de la araña semiacuática Ancylometes bogotensis (n=42), empleando un marcador nuclear y uno mitocondrial. Ancylometes bogotensis se recuperó dentro de la familia Ctenidae, formando dos clados fuertemente estructurados por la cordillera oriental colombiana sin evidencia de flujo genético entre ellos. La diferenciación dentro de esta especie coincide con el levantamiento de dicha cordillera (~2.76Ma). Por lo tanto, este caso se constituye en uno de los pocos casos en artrópodos donde se documenta divergencia por vicarianza continental.
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    Diversity of mycorrhizal types along altitudinal gradients in mountain tropical forests of northern South America
    (2020-07-17) Rendón Espinosa, Miguel Ángel; Bottin, Marius
    Los hongos micorrízicos juegan un papel clave en el funcionamiento de los ecosistemas terrestres. Los principales tipos de asociaciones de micorrizas son micorrizas arbusculares (AM), ectomicorrizas (EcM), micorrizas ericoides (ErM) y micorrizas de orquídeas (OM). Estudios anteriores han demostrado que la abundancia de plantas AM, ECM y ErM cambia gradualmente a lo largo de gradientes latitudinales y altitudinales impulsados ​​por los efectos del clima en la descomposición, reflejados en la acumulación de carbono y nutrientes en el suelo. La cordillera de los Andes colombianos alcanza altitudes superiores a los 5.000 my es un gran sistema para probar los efectos de la altitud en los ecosistemas tropicales. Nuestro objetivo fue comprender cómo la altitud y las condiciones climáticas y del suelo dan forma a los patrones de distribución de los tipos de micorrizas en las especies de plantas distribuidas en esta región. Para probar esto, usamos una base de datos de registros de plantas de herbario y asignamos el tipo de micorrizas según la literatura disponible. También utilizamos variables bioclimáticas y edáficas a una resolución de 10 km. Calculamos la proporción de cada uno de los diferentes tipos de asociaciones de micorrizas por celda de cuadrícula y creamos un índice de diversidad para explorar su distribución espacial y su asociación con factores abióticos basados ​​en GLM. Encontramos que la diversidad de asociaciones de micorrizas aumenta con la altitud y la reserva de carbono del suelo.
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    DNA barcoding for identification and phylogenetic inference of (Diptera; Ceratopogonidae) pollinators of cacao
    (2023) Tamayo Ceballos, Iván Mateo; Richardson, James Edward; Sánchez Andrade, Adriana; Salazar Clavijo, Camilo Andrés; Yockteng, Roxana
    La pérdida de biodiversidad está ocurriendo a gran escala y la necesidad de monitorearla es cada vez más necesaria. El uso de técnicas morfológicas se puede mejorar con el uso de herramientas moleculares para ayudar a resolver los vacíos en el conocimiento de la diversidad y la historia evolutiva de las especies. El objetivo de esta investigación fue evaluar el uso del gen mitocondrial citocromo c oxidasa 1 (COI) como marcador de código de barras de ADN para caracterizar mosquitos como posibles polinizadores en cultivos de cacao colombianos. El estudio se implementó en los departamentos del Meta y Norte de Santander. Los taxones muestreados directamente de las flores se analizaron para evaluar su diversidad y relación filogenética utilizando la máxima verosimilitud (ML) y la inferencia bayesiana (BI). Generamos secuencias de aproximadamente 656 pb para 25 individuos Culicomorpha, 13 del Meta y 12 del Norte de Santander y descargamos 388 secuencias de las familias Ceratopogonidae y Chironomidae de GenBank. El análisis de las secuencias COI revela que nuestras secuencias se ubicaron en tres grupos de linajes de Ceratopogonidae (Forcipomyia, Dasyhelea y Stilobezzia) y cinco linajes no resueltos de Chironomidae. También encontramos que las especies que visitaron las flores de cacao en las plantaciones de Meta y Norte de Santander representaban dos grupos separados, que pueden estar influenciados por los procesos orogénicos de las montañas de los Andes. La reconstrucción filogenética indicó que la mayoría (n=17) de nuestras secuencias se resolvieron en el grupo Forcipomyia. Adicionalmente, ninguna de nuestras secuencias fue idéntica a las secuencias de GenBank, lo que refleja un sesgo de investigación para las regiones templadas del norte y la necesidad de más estudios sobre especies tropicales. Nuestros datos ofrecen nuevas secuencias moleculares de Ceratopogonidae colombianos para el desarrollo de un inventario global de especies polinizadoras de plantas de interés económico, como el cacao. Se sugiere también la necesidad de seguir muestreando taxones tropicales para esclarecer la historia evolutiva de estas familias de moscas.
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    Efecto de cambios ambientales en rasgos morfológicos y sensoriales asociados a la especialización de labores en la abeja de la miel Apis mellifera
    (2020-08-06) Herrera Gutiérrez, Laura Herrera; Riveros Rivera, André Josafat
    La división de labores es el cimiento de la organización social de los insectos. La eusocialidad se caracteriza por, además de otros factores, la división de castas laborales. Uno de los factores que determinan la asignación de labores autoorganizadas es el modelo de umbral de respuesta, que asume que la especialización depende de la variabilidad en la sensibilidad a estímulos asociados con la realización de una tarea. En el caso de Apis mellifera, la recolección de agua, polen y néctar principalmente. La disponibilidad de estos recursos puede variar en el tiempo debido a cambios en factores ambientales. En este estudio se propone que en A. mellifera la especialización en labores de recolección se relaciona con diferencias en el tamaño y número de rasgos morfológicos y sensoriales los cuales están asociado a cambios en variables ambientales a través del tiempo. Los resultados muestran que un aumento en la precipitación puede generar que las magnitudes de los rasgos morfológicos disminuyan, mientras que los rasgos sensoriales tienen un comportamiento diferente. Por otro lado, las abejas especializadas en la recolección de polen y la mezcla de polen-líquido, las cuales son similares entre sí, tienden a tener mayor tamaño corporal y número de sensilas que las recolectoras de líquido.
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    Efecto de la hipoxia y la exposición a radiaciones ionizantes sobre la captación de glucosa en líneas celulares derivadas de tumores de seno y colon
    (2021-09-05) Moreno Navarro, Paula Alejandra; Ondo Méndez, Alejandro Oyono
    El cáncer es una patología que se caracteriza por presentar una alta proliferación, heterogeneidad y supervivencia de células anormales. Bajo ambientes como hipoxia e irradiación las células tumorales inducen cambios en la expresión genética y metabólica que les permite adaptarse a las exigencias del microambiente tumoral. Gracias a procedimientos como el PET, podemos utilizar la captación de glucosa como un método para predecir la respuesta de los tumores aprovechando el alto flujo glucolítico de estas células. Debido a lo anterior, el objetivo del presente estudio fue evaluar el efecto de la hipoxia e irradiación sobre la captación de glucosa en líneas tumorales de cáncer de seno y colon usando una sonda análoga de glucosa. Aquí describimos un protocolo que usa la sonda de glucosa fluorescente (2 NBDG) en tres líneas celulares de MCF-7, HT-29 y EA.hy926 bajo distintos tratamientos experimentales, seguido de un mejoramiento de las imágenes de fluorescencia. Nuestros resultados indican una disminución en la captación de glucosa bajo el tratamiento de hipoxia y reoxigenación en las líneas celulares de EA.hy926, MCF-7 y HT29. Mientras que, en el tratamiento con irradiación, se observó un aumento significativo solamente en la línea tumoral HT-29 con respecto al control. Se sugiere que el periodo reoxigenación tuvo un efecto positivo en las células de MCF-7 y EA.hy926, mientras que en la línea tumoral HT-29 no se establece relación y se plantea un posible indicio de radioresistencia.
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    Efectos de la elevación sobre la alometría sensorial en la abeja de la miel, Apis mellifera
    (2020-08-12) Barragán Barrera, Heidy Natalia; Riveros Rivera, André Josafat
    Las variaciones en el tamaño corporal representan un motor para la colonización de nuevos nichos representado en patrones ecogeográficos. La ley de Bergmann describe un patrón ecogeográfico donde las especies con mayor tamaño corporal se distribuyen a mayor latitud. No obstante, la ley de Bergmann sensu lato incluye factores abióticos como temperatura y altitud. En consecuencia, la ley de Bergmann sensu lato extiende el patrón modificado a distintos grupos que antes no se habían incluido, como en el caso de la Clase Insecta. Se sabe que las variaciones en el tamaño corporal de los insectos influyen en las dinámicas de forrajeo. Por lo tanto, la información ambiental que perciben y procesan los insectos varía con cambios en el tamaño corporal absoluto y relativo. En este estudio se evaluó la ley de Bergmann sensu lato aplicada en A. mellifera con respecto a una clina altitudinal en dos zonas de la cordillera oriental colombiana; evaluando variaciones de rasgos morfométricos y sensoriales, además de su relación con la percepción de la información olfativa y sus consecuencias en las actividades de forrajeo. Se encontró que las abejas de menor elevación presentaron menor magnitud para rasgos sensoriales y morfométricos a diferencia de las abejas que se distribuyen en la localidad con mayor elevación. Este patrón responde al principio de la ley de Bergmann sensu lato en función de una clina altitudinal. Las variaciones alométricas a nivel morfométrico registradas en el estudio tienen efecto en los rasgos sensoriales de A. mellifera. En consecuencia, se puede sugerir como la temperatura asociada a la altitud moldea las comunidades de A. mellifera, específicamente en tareas de polinización.
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    Effect of seasonal rains and floods in seedling recruitment and compositional affinity in two lowland tropical forests
    (2020-07-30) Polanía Camacho, Brayan Steven; Sánchez Andrade, Adriana; Aldana Serrano, Ana María; Bottin, Marius
    Introducción: Los bosques inundables estacionales y de tierra firme son ecosistemas característicos de la Orinoquia colombiana y de gran importancia en el mantenimiento de biodiversidad y funciones ecosistémicas regionales. Estos bosques están bajo un pulso de precipitación unimodal que puede ejercer un efecto de división temporal sobre el nicho de regeneración de plántulas. Esto podría explicar la alta diversidad y coexistencia de especies vegetales en estos bosques, así como la afinidad composicional entre adultos y plántulas que refuerza el ensamblaje de la comunidad en bosques maduro. Objetivo: Nuestro objetivo fue evaluar el efecto de la inundación estacional y de las lluvias de temporada sobre la disimilitud y afinidad composicional entre adultos y plántulas de un bosque inundable y de tierra firme. Métodos: Para esto, caracterizamos la comunidad de adultos de estos bosques en San Martín (Meta) y la comparamos con sus respectivas comunidades de plántulas antes y después de la temporada de inundación y lluvias usando análisis de disimilitud de Bray-Curtis y NMDS. Resultados: Encontramos que posterior a las inundaciones disminuyó significativamente la disimilitud florística entre adultos y plántulas del bosque inundable y aumentó significativamente la afinidad entre estos; sin embargo, este patrón no fue tan concluyente en el bosque de tierra firme. Conclusiones: Estos resultados podrían indicar que las inundaciones estacionales pueden causar división temporal sobre el nicho de las plántulas. Sin embargo es importante profundizar en el rol de variables edáficas posiblemente afectadas por la inundación y las lluvias. Nuestros resultados pueden aportar información para el desarrollo efectivo de programas de restauración asistida y conservación.
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    Effect of social instability on social recognition and partner preference in guinea pigs, Cavia porcellus
    (2025-04-23) Pantoja Ruíz, Valentina; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra
    La inestabilidad social desencadena diversas respuestas fisiológicas y endocrinológicas al estrés. Las fluctuaciones hormonales inducidas por el estrés y reguladas por el eje HPA modulan los procesos sociales y de memoria. En este estudio, evalué el efecto de la inestabilidad social sobre la preferencia y el reconocimiento social en cobayas (Cavia porcellus) y medí los niveles de cortisol (CORT) y oxitocina (OT) en sangre. Mis resultados mostraron que la inestabilidad social afecta a la preferencia social, pero no afectó significativamente al reconocimiento social ni a los niveles de CORT u OT. Estos resultados sugieren que la inestabilidad social afecta a los procesos sociales, como los procesos de toma de decisiones sociales, independientemente de los cambios inmediatos en CORT y OT circulantes, contribuyendo a nuestra comprensión de la interacción entre el estrés social y el comportamiento social.
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    Effects of fire on functional traits and diversity of Puya in the Colombian páramo
    (2024-02-27) Pinzon Bustos, Juan Jose; Sánchez Andrade, Adriana; Hantson, Stijn Erik R
    El fuego es el principal disturbio natural que ha transformado el paisaje global, consumiendo biomasa superficial y alterando las propiedades fisicoquímicas del suelo. Sin embargo, la intervención antropogénica ha aumentado la frecuencia de esta perturbación, afectando varios ecosistemas, incluido el páramo, un ecosistema montañoso andino de gran altitud. En este ecosistema, hay indicios de que el fuego facilita el establecimiento de especies del género poco estudiado Puya. Para investigar más a fondo su respuesta al fuego, se establecieron transectos en áreas impactadas por incendios en 1988 y 2002, así como en áreas no perturbadas (ningún incendio antes de 1985). El estudio tuvo como objetivo comprender cómo el fuego interactuaba con la diversidad y abundancia de especies, sus rasgos funcionales aéreos, subterráneos y la colonización de micorrizas. Nuestros resultados revelaron que en los transectos no perturbados, hubo una mayor diversidad de plantas (cuatro especies) y que la perturbación por incendios condujo a una disminución en la riqueza de especies. En los transectos afectados por el incendio de 2002, sólo estuvo presente Puya goudotiana. Curiosamente, esta especie no sufrió cambios en los rasgos funcionales al comparar individuos que crecían en condiciones sin quema con aquellos afectados por el fuego. Puya nitida estuvo presente en los transectos de 1988 y sin incendio y exhibió una ramificación de raíces significativamente mayor y un diámetro de raíz más bajo en condiciones no perturbadas. La colonización de micorrizas no mostró diferencias significativas entre especies o tiempo desde la perturbación del fuego. Considerando la importancia ecológica de Puya en el ecosistema de páramo y el gran impacto que tiene el fuego en la abundancia y diversidad, se necesita más investigación sobre el género para comprender mejor cómo estas plantas responden a los eventos de perturbación y colonización en las áreas afectadas.
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    El Maguey y su significado para los Kankuamos: un análisis del impacto del cambio climático desde una perspectiva interdisciplinar
    (2025-03-03) Estrada Zuleta, Juliana Margarita; Quesada, Benjamín Raphael; Sánchez Andrade, Adriana
    El Maguey, una de las plantas más emblemáticas para los Kankuamos, destaca no solo por su uso en tejidos tradicionales (como mochilas, chinchorros, cabuya), sino también, por su significado cultural y su conexión con el territorio. Sin embargo, la crisis climática plantea una amenaza sobre esta especie, generando preocupación por cómo estos cambios podrían alterar su existencia y, por ende, a la misma cultura. Desde un tejido interdisciplinario, se combinaron herramientas científicas -como MaxEnt- para modelar la distribución actual y futura del Maguey (2081-2100), con el sistema de conocimiento indígena de los saberes tradicionales de este pueblo. Estos se obtuvieron través de entrevistas semiestructuradas y cartografía participativa. Además, se pudo evaluar la distribución potencial de esta planta bajo escenarios climáticos SSP 2.45 (mitigación moderada) y SSP 5.85 (baja mitigación). Este diálogo permitió interpretar su rol tradicional y simbólico como eje de la resistencia Kankuama. Los resultados revelaron que el Maguey podría duplicar su área potencial de distribución bajo el escenario de alto calentamiento SSP 5.85; sin embargo, esto no garantiza condiciones óptimas para su desarrollo y productividad, debido a diversas amenazas como plagas y eventos climáticos extremos. Por lo que, más allá de su adaptabilidad ecológica, la planta se posiciona como símbolo de resistencia y elemento esencial. “Tiene vida y significado para nosotros”. Al entrelazar estos sistemas de conocimiento, se promueve la comprensión holística de problemáticas socioambientales, permitiendo construir estrategias de conservación en conjunto frente a los desafíos y desarmonías ambientales que presentamos en la actualidad.
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    Acceso Abierto
    ¿Es la coloración aposemática de las mariposas heliconius una señal honesta de su toxicidad?
    (2022-08-08) Ramírez Romero, Juan Pablo; Salazar, Camilo; Rueda, Nicol
    Los patrones de color en especies miméticas müllerianas están fuertemente relacionadas a la evolución de defensas químicas. Uno de los ejemplos clásicos de mimetismo son las mariposas heliconius donde hay una alta variación geográfica de anillos miméticos. A pesar de la amplia investigación que hay sobre la coloración y la toxicidad de este grupo de mariposas, la relación entre ambos caracteres aún no ha sido estudiada y se desconoce si la señal de advertencia es cuantitativamente honesta. En este estudio se cuantificaron los compuestos cianogénicos y los contrastes de color de dos anillos miméticos bajo condiciones de luz y dos modelos de visión de las aves. La relación entre estas dos variables se evaluó por medio de la implementación de modelos lineales (lm). No se encontró correlación entre la coloración y la toxicidad, pero si entre esta última y las especies. Adicionalmente, se encontró variación entre los perfiles químicos de especies de un mismo anillo, así como también entre localidades geográficas. La limitación del recurso, las relaciones filogenéticas y otros factores adicionales podrían contribuir a explicar la asociación de la toxicidad a un mismo patrón de coloración.
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    Restringido
    Establishing nitrogen acquisition strategies of Bejaria resinosa Mutis ex L. (Ericaceae) from low fertility soils of Colombia
    (2023-02-27) Ortiz Suárez, Antony; Corrales Osorio, Adriana; ECOFUNGI
    • A key question about plants’ interaction with their environment is which strategies do they have for nutrient acquisition. We aimed to determine the different mechanisms used by Bejaria resinosa to obtain nitrogen. Carnivory, mutualism with insects and mycorrhizas were potential pathways tested in this study. • We compared nitrogen and carbon natural isotopes from apical organs and roots of B. resinosa with isotopes from carnivorous plants, ericoid mycorrhizal plants, arthropods, and fungi. We also, performed an ecological and anatomically characterization of the plant using electronic microscopy, protease production tests and field observations of arthropods’ interactions. • Organs of B. resinosa showed differentiation in their carbon and nitrogen isotopic signatures. We did not find significant differences in the 𝛿15N signature of B. resinosa compared with carnivorous plants, but found statistical differences in the 𝛿13C. Diptera and Hymenoptera were usual insects’ orders found trapped in Bejaria’s flowers and leaves. We found glandular and non-glandular trichomes in Bejaria’s leaves. • Comparisons of the isotopic signature of B. resinosa with carnivorous plants suggests that B. resinosa could obtain N from an 15N enriched source such as arthropods trapped on its apical organs. Even though plant isotopic signature could be affected by several ecological factors, the evidence compiled in this study suggests a potential case of holocarnivory of B. resinosa. Holocarnivory could observed in plants in the absence of protease production and pores in the leaf cuticle. Experimental studies are necessary to confirm if B. resinosa is a carnivorous plant
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    Estandarización del proceso de aislamiento de vesículas extracelulares en células de cáncer de mama triple negativo
    (2022-08-09) Rodríguez, Juan Felipe; Martínez Agüero, Magdalena María; Rincón Riveros, Andrés; Grupo de Investigación Moléculas Biológicas y Actividad Celular
    Las vesículas extracelulares (EV) son estructuras delimitadas por una membrana lipídica que son secretadas por casi todos los tipos de células al espacio extracelular. Están involucradas en diferentes procesos de comunicación celular; particularmente, se ha identificado que las EV derivadas de células cancerosas desempeñan un papel importante en la modificación del microambiente tumoral ya que tienen la capacidad de transportar diferentes tipos de biomoléculas como proteínas y tipos de RNA, que actúan como reguladores en el ciclo celular. Estas características permiten el uso de EV como biomarcadores para el diagnóstico y seguimiento de diferentes patologías, entre ellas el cáncer de seno, así como su uso en terapias dirigidas. El objetivo de este estudio consistió en estandarizar una metodología para el aislamiento de EV presentes en el medio sobrenadante de cultivo de dos líneas celulares de cáncer de mama, así como su caracterización mediante el uso de técnicas basadas en anticuerpos. Los resultados muestran que las vesículas producidas por las células, tanto en cáncer luminal A como en triple negativo, tienen micro RNA (miRNA), por lo que se constituyen efectivamente en una herramienta para diagnóstico y seguimiento de la enfermedad. Finalmente, este estudio permitió el aislamiento de EV a partir de cultivo celular comprobando la eficiencia de las columnas SEC qEV2 de IZON en laboratorios ubicados sobre los 2000 m.s.n.m y eliminando la contaminación por EV provenientes del suero fetal bovino (SFB) sin afectar significativamente la viabilidad del cultivo celular usando medio de cultivo sin suplementar
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    Estimación del tamaño de las colonias de guácharos (Steatornis caripensis) en cuevas del departamento de Santander
    (2023-08-18) Pineda Dueñas, Juan Diego; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra; Alarcón Nieto, Gustavo; Grupo de Ecología Funcional y Ecosistémica (EFE)
    La estimación de la población es clave para establecer tendencias poblacionales y evaluar los riesgos de extinción de una especie. En estudios de aves coloniales o nocturnas, los métodos tradicionales de estimación presentan sesgos que dificultan la confianza y la interpretación de los resultados, lo que crea la necesidad de generar nuevas técnicas que superen estas dificultades. El guácharo (Steatornis caripensis) es un ave nocturna y colonial estrictamente frugívora que se posa en cuevas. En zonas con bosques continuos, las colonias pueden alcanzar los 20.000 individuos. Sin embargo, la información sobre colonias que habitan zonas con bosques fragmentados es aún escasa. Mi objetivo era estimar el tamaño de las colonias de aves oleícolas en nueve cuevas del departamento de Santander, Colombia, utilizando un método estandarizado de recuento por puntos junto con cámaras térmicas en el exterior y el interior de las cuevas. Mis resultados indican que el tamaño de las colonias varió entre 11 y 1524 individuos en los meses de enero y junio, y no mostró diferencias entre las estaciones reproductiva y no reproductiva. Asimismo, entre el 0 y el 34,7% de la población total de la colonia permaneció en la cueva tras un fuerte pico de actividad. Mis estimaciones basadas en imágenes térmicas son comparables con el método tradicional de recuento por puntos y brindan ventajas adicionales como el almacenamiento de los datos, y pueden ser analizados en otros aspectos, esto respalda el uso de tecnología no invasiva en el estudio de la vida silvestre.
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    Embargo
    Estructura genética de Xiphorhynchus susurrans como posible adaptación al gradiente climático del Valle del Magdalena
    (2026-03-10) Osorio Betancourt, Ana Sofía; Salazar Clavijo, Camilo Andrés; Gómez Echeverría, Juan Pablo
    La diversificación en el Neotrópico ha sido atribuida en gran medida a la presencia de barreras orográficas, ocasionando que el papel de mecanismos como los gradientes climáticos dentro de unidades geográficas continuas haya sido menormente explorado. El Valle del Magdalena, una región de alta biodiversidad, es una cuenca interandina donde se evidencia una transición climática drástica coincidente con limites biogeográficos reconocidos, lo que podría modular el flujo genético a lo largo del mismo. En este contexto, se evaluó si la variación genética y morfológica de Xiphorhynchus susurrans, un ave con distribución en el valle y sin barreras físicas internas que limiten su dispersión, se asocia con el gradiente climático más que con la distancia geográfica. Se analizaron nueve poblaciones (42 individuos) mediante ddRAD-seq y mediciones de rasgos morfológicos, evaluando la conectividad genética y su relación con la variabilidad climática del Valle del Magdalena. Se identificaron dos grupos a nivel genético y morfológico correspondientes a las ecorregiones del Alto y Medio Magdalena, con una zona de mayor conectividad en la transición del bosque húmedo al seco. El patrón de flujo génico está modulado principalmente por la precipitación anual, de manera independiente la variación de cuatro rasgos morfológicos también mostró correlaciones significativas con el gradiente ambiental del Valle. Estos resultados sugieren que la heterogeneidad climática en valles interandinos puede promover la diferenciación intraespecífica incluso en ausencia de barreras geográficas, patrón consistente con procesos de aislamiento por ambiente (IBE).La diversificación en el Neotrópico ha sido atribuida en gran medida a la presencia de barreras orográficas, ocasionando que el papel de mecanismos como los gradientes climáticos dentro de unidades geográficas continuas haya sido menormente explorado. El Valle del Magdalena, una región de alta biodiversidad, es una cuenca interandina donde se evidencia una transición climática drástica coincidente con limites biogeográficos reconocidos, lo que podría modular el flujo genético a lo largo del mismo. En este contexto, se evaluó si la variación genética y morfológica de Xiphorhynchus susurrans, un ave con distribución en el valle y sin barreras físicas internas que limiten su dispersión, se asocia con el gradiente climático más que con la distancia geográfica. Se analizaron nueve poblaciones (42 individuos) mediante ddRAD-seq y mediciones de rasgos morfológicos, evaluando la conectividad genética y su relación con la variabilidad climática del Valle del Magdalena. Se identificaron dos grupos a nivel genético y morfológico correspondientes a las ecorregiones del Alto y Medio Magdalena, con una zona de mayor conectividad en la transición del bosque húmedo al seco. El patrón de flujo génico está modulado principalmente por la precipitación anual, de manera independiente la variación de cuatro rasgos morfológicos también mostró correlaciones significativas con el gradiente ambiental del Valle. Estos resultados sugieren que la heterogeneidad climática en valles interandinos puede promover la diferenciación intraespecífica incluso en ausencia de barreras geográficas, patrón consistente con procesos de aislamiento por ambiente (IBE).
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    Acceso Abierto
    Evaluación de servicios, diservicios ecosistémicos y motores de cambio a partir de valoración sociocultural en Coyaima, Colombia
    (2020-07-30) Tovar Tique, Yuli Paola; Escobedo, Francisco Javier; Clerici, Nicola
    La investigación sobre servicios ecosistemicos (SE), diservicios ecosistemicos (dSE) y motores de cambio (MCs) en Colombia es mínima. Además, pocos estudios evalúan los SE desde las percepciones de las personas y su contexto en el territorio. Esto tiene consecuencias en la toma de decisiones que planifican y transforman el territorio. Por tanto, los principales SE para las personas de un municipio de Colombia fueron analizados y su relación con un dSE y MC. Entrevistas y encuestas identificaron los principales SE, dSE y MCs que percibe la comunidad. Luego usando proxies de SE y Sistemas de Información Geográfica, se cuantificó el suministro de dos principales SE y un dSE. Por último, se analizó la relación estadística entre los principales SE y MC durante el periodo 2005 - 2017. Se encontró que según las personas los principales SE son purificación del aire y producción de alimentos. Los dSE son altas temperaturas y quemas, mientras que MCs son arrojo de basuras y quemas. Purificación del aire se mantuvo aproximadamente constante (116 t), producción de alimentos (49 t/ha) y el dSE quemas aumenta y no hubo correlación significativa entre el suministro de los SE y el MC. Por tanto, se recomienda un trabajo conjunto entre las comunidades locales y las instituciones territoriales para fortalecer el SE de purificación del aire y mantener la producción de alimentos con prácticas agrícolas sostenibles. Se sugiere realizar las evaluaciones a escala local, ya que permiten una comprensión más profunda de los SE y/o usos de la tierra a los encargados de toma de decisiones.
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    Acceso Abierto
    Evaluando caracteres funcionales de plantas en páramo y su relación con factores climáticos
    (2019-01-28) Pedraza, Sara Sofía; Sánchez Andrade, Adriana
    Muchas de las plantas que habitan en el páramo tienen una distribución restringida en el ecosistema. Para lograr subsistir en este ecosistema, que posee condiciones abióticas extremas, las plantas cuentan con rasgos funcionales específicos. El análisis de rasgos funcionales es fundamental dada su importancia para el desarrollo y supervivencia de los organismos, sin embargo, para el páramo no hay análisis como estos a gran escala. El presente estudio se enfoca en entender la relación entre los caracteres funcionales de las plantas de páramo y las variables climáticas, con miras a analizar el posible efecto que el cambio climático pueda tener sobre la vegetación. Para ello se realizó una extensa revisión bibliográfica recolectando información de los caracteres funcionales; luego se compararon los rasgos entre páramo y sub-páramo, y por último se evaluó la correlación de los rasgos funcionales con las variables climáticas. Se encontró que todos los caracteres, a excepción de área foliar (LA), presentan diferencias significativas entre páramo y sub-páramo; además, los caracteres de contenido de materia seca foliar (LDMC), densidad de madera y altura máxima (Hmax) muestran correlaciones con algunas variables climáticas.
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    Acceso Abierto
    Exploring the abdominal microbiome of two Heliconius species in the Central Colombian Andes
    (2021-05-28) Salazar-Sastoque, Maria Paula; Sánchez Herrera, Melissa; Khazan, Emily
    Las comunidades microbianas del intestino tienen funciones importantes en la reproducción, digestión y protección contra patógenos de los insectos hospedadores. Dada la importancia de estas comunidades endosimbióticas para su anfitrión, la investigación sobre la diversidad y ecología de los microbiomas está recibiendo cada vez más atención. Quería probar la importancia de las especies hospedadoras y la geografía en la configuración de la composición del microbioma. Utilizando la región V4 del gen 16S, comparé las comunidades de microbiomas de dos especies de mariposas en dos ubicaciones geográficas. Usé 14 individuos de dos especies, Heliconius cydno y Heliconius clysonymus, capturadas en reservas forestales en Manizales, Caldas y Filandia, Quindío, en la Cordillera Central de los Andes colombianos. Los índices de diversidad alfa, incluidos Shannon e Inverse Simpson, demostraron similaridades en la diversidad taxonómica entre especies y sitios, pero con cambios en la abundancia entre las especies de mariposas. El análisis de coordenadas principales (PCoA) de las comunidades microbianas de individuos mostró que la variabilidad en los microbiomas se desacoplaba de la identidad y el sitio de las especies. Proteobacteria fue el filo más abundante en todas las muestras y Commensalibacter fue el género bacteriano más común. Además, encontramos la presencia de simbiontes intracelulares Spiroplasma y Wolbachia en nuestras muestras.
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    Acceso Abierto
    Exploring the phylogeographic patterns and genetic diversity of urban cockroaches (Dictyoptera:Blattodea) of Bogota, Colombia.
    (2020-01-24) De Martino Fonseca, Frasella Paola; Sánchez Herrera, Melissa
    Las cucarachas son uno de los insectos más exitosos del planeta debido a sus adaptaciones morfológicas y fisiológicas que les permiten tener una amplia distribución en el mundo. Algunas especies tiene la habilidad de habitar viviendas humanas y propagar enfermedades y microorganismos, razón por la cual son consideradas pestes domiciliarias. Aquí queremos identificar las especies de cucarachas urbanas habitando en tres localidades de Bogotá D.C, establecer sus relaciones filogenéticas con otras poblaciones de la misma especie a través del mundo y explorar la diversidad y estructuración genética entre las localidades evaluadas. Para lograr estos objetivos usamos dos amplicones de ADNmt: el fragmento ribosomal 16S (~400pb) y el gen Barcode COI (~600pb). Colectamos un total de 44 individuos en las localidades de Bosa, Kennedy y Chapinero. Molecularmente se identificó 1 individuo de Periplaneta americana, 1 de Periplaneta brunnea y 42 individuos de Blattella germanica. Las reconstrucciones filogenéticas no mostraron un patrón geográfico claro de parentesco para las tres especies, consistente con la dispersión mediada por humanos. Para la especie más común, Blattella germanica, se estableció la diversidad genética y la diferenciación poblacional en las tres localidades estudiadas. Nuestros resultados sugieren una alta diversidad genética para el gen COI, sin embargo esta no está explicada por una proximidad geográfica entre las poblaciones. Finalmente, la estructuración genética (FST) entre las poblaciones indica un flujo genético existente entre las localidades, sugiriendo que estas no representan una barrera y que el transporte mediado por humanos puede ayudar en el intercambio genético para estas poblaciones.
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    Fear in urban tropical ecosystems: Flight initiation distance of birds in an urbanization gradient
    (2021) Ardila Villamizar, Laura Melissa; Maldonado Chaparro, Adriana Alexandra; Alarcón Nieto, Gustavo
    Los disturbios antropogénicos afectan la respuesta anti-depredatoria de los animales. Los animales urbanos exhiben distancias de escape (FID, por sus siglas en inglés) más cortas en comparación con sus contrapartes rurales. Las respuestas de escape han sido muy estudiadas en animales en hábitats completamente urbanos o rurales; sin embargo, poco se sabe acerca de cómo varía dentro de las ciudades, especialmente en el trópico. En este estudio investigué las respuestas anti-depredatorias de aves residentes de Bogotá, Colombia. Seleccioné 22 sitios con diferentes niveles de urbanización que representan la heterogeneidad del hábitat, y evalué cuáles factores extrínsecos e intrínsecos afectan la respuesta de escape y la variación del FID a lo largo del gradiente de urbanización. Los resultados indican que las aves que forrajean en bandadas más grandes son más tolerantes a las aproximaciones de humanos y que la respuesta de escape difiere entre sitios con diferentes niveles de urbanización. Contrario a lo esperado, solo se encontraron diferencias entre aves en zonas naturales y urbanas (parques y áreas residenciales), pero no entre parques y áreas residenciales. En general, las aves que se encuentran en áreas residenciales exhibieron distancias de escape más cortas que las aves en áreas naturales. Esto indica que las aves en áreas naturales son menos tolerantes a la presencia humana que las aves que se encuentran en áreas urbanas con mayor grado de intervención humana. Nuestros resultados nos permiten entender cómo los animales responden a los crecientes niveles de intervención humana y cómo estas respuestas son importantes para mantener la biodiversidad urbana.
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    Fire and grazing as drivers of functional trait variability in flooded savannas of Colombia
    (2026-03-10) Segura Forigua, Luisa Nicole; Hoyos Gauta, Yessica Dayana; Estrada Villegas, Sergio; Ramos, Laura Isabel; Fernandes Amaral, João Henrique; Hantson, Stijn Erik R; Sánchez Andrade, Adriana; Sánchez Andrade, Adriana; Estrada Villegas, Sergio
    Las sabanas del oriente de Colombia están moldeadas por el fuego y el pastoreo recurrentes, dos disturbios contrastantes que imponen presiones selectivas opuestas sobre los rasgos funcionales de las plantas. Las plantas pueden responder mediante variabilidad intraespecífica de los rasgos (ITV) asociada a la plasticidad fenotípica; sin embargo, estas respuestas están limitadas porque algunos rasgos permanecen canalizados, lo que puede favorecer la aparición de estrategias funcionales diferenciadas. Evaluamos el efecto del fuego y el pastoreo sobre la ITV en gramíneas dominantes de sabanas estacionalmente inundables de Casanare, Colombia. Medimos 15 rasgos funcionales aéreos y subterráneos en tres especies dominantes (Anatherum bicorne, Acroceras zizanioides y Rugoloa polygonata) bajo cuatro regímenes de disturbio (pastoreo, fuego, fuego + pastoreo y sin disturbio). Se observó una ITV considerable, mayor en los rasgos aéreos que en los subterráneos. Sin embargo, solo algunos rasgos mostraron ITV dependiente del tratamiento, mientras que la mayoría varió independientemente del disturbio. La plasticidad fenotípica difirió entre rasgos y especies, y varios rasgos aéreos presentaron respuestas canalizadas pese a la exposición al disturbio. Esta plasticidad diferencial sustentó estrategias funcionales contrastantes: A. bicorne mostró una estrategia asociada al fuego, A. zizanioides al pastoreo y R. polygonata una estrategia generalista. Los cambios fueron más marcados en los rasgos aéreos, probablemente por su mayor exposición a la variabilidad ambiental, mientras que los rasgos subterráneos respondieron menos debido a condiciones edáficas más estables. En conjunto, los resultados indican que la ITV por sí sola no explica completamente las respuestas de las plantas al fuego y al pastoreo, resaltando el papel de la canalización de rasgos y de las estrategias funcionales específicas de cada especie.
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    Fire legacies persist for decades in the interactions of the root-associated microbiota of Puya goudotiana
    (2025-08-29) Rodríguez Lugo, Nataly Alejandra; Patiño, Luz Helena; Cáceres, Tatiana; Vega, Laura; Hantson, Stijn Erik R; Ramírez González, Juan David; Sánchez Andrade, Adriana; Grupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)
    El fuego es un proceso ecológico que puede tener efectos a largo plazo en la estructura y el funcionamiento de los ecosistemas, incluidas las propiedades del suelo y las comunidades microbianas asociadas a las plantas. Esto también ocurre en los ecosistemas de páramo, donde el fuego actúa como una perturbación recurrente. En este ecosistema altoandino, la bromelia endémica Puya goudotiana ha demostrado una alta tolerancia a las temperaturas elevadas. Sin embargo, se desconoce el efecto del fuego sobre la microbiota asociada a las raíces de esta especie. Por lo tanto, evaluamos las comunidades bacterianas y fúngicas en muestras de raíces y suelo circundante de P. goudotiana a lo largo de una cronosecuencia de incendios (incendios en 2002, 1988 y un control sin fuego), utilizando secuenciación de última generación basada en amplicones dirigida a las regiones 16S y 18S rARN, junto con un análisis fisicoquímico de suelos. A largo plazo, el fuego promovió una mayor diversidad bacteriana, pero no tuvo un efecto significativo en las propiedades del suelo ni en la composición de las comunidades bacterianas y fúngicas en comparación con las áreas no quemadas. Además, las comunidades microbianas estaban altamente diferenciadas entre muestras de raíces y suelo circundante. Proteobacteria (~30 %) y Ascomycota (~55 %) fueron los filos más abundantes. No obstante, la conectividad de las redes microbianas aumentó con el fuego. Veinte años después de un incendio, las comunidades microbianas interactuaban de forma más negativa, mostrando patrones de dominancia de bacterias copiótrofas. Sin embargo, casi 40 años después del incendio, las redes mantenían interacciones mayoritariamente positivas entre hongos y bacterias, lo que difería del estado previo al incendio. Destacamos el papel de la severidad del fuego y el clima del páramo en la conformación de las propiedades del suelo y la composición microbiana. Futuros estudios deberían evaluar la funcionalidad microbiana e intervalos de incendios más cortos para comprender mejor la dinámica de recuperación tras incendios.