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Acceso Abierto
Gut microbiota profiles in diarrheic patients with co-occurrence of Clostridioides difficile and Blastocystis
Título de la revista
Autores
Vega, Laura
Herrera, Giovanny
Muñoz, Marina
Patarroyo, Manuel A.
Maloney, Jenny G.
Santín, Monica
Ramírez, Juan David
Archivos
Fecha
2021
Directores
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Resumen
La co-ocurrencia de Blastocystis y Clostridioides difficile se considera un evento raro ya que la colonización por Blastocystis se previene bajo una disminución de bacterias beneficiosas en la microbiota cuando hay infección por C. difficile (ICD). Este escenario se informó una vez, pero no hay información disponible sobre el perfil de la microbiota intestinal. El presente estudio está motivado por saber qué miembros de la microbiota se pueden encontrar en este raro escenario y cómo esta co-ocurrencia puede afectar la abundancia de otras bacterias, eucariotas o arqueas presentes en la microbiota intestinal. Este estudio tuvo como objetivo describir las comunidades bacterianas y eucarióticas utilizando la secuenciación basada en amplicones de las regiones 16S- y 18S-rRNA de tres grupos de pacientes: (1) Blastocystis y infección por C. difficile (B+/C+, n = 31), (2 ) Solo infección por C. difficile (B−/C+, n = 44), y (3) sin Blastocystis o C. difficile (B−/C−, n = 40). Blastocystis se subtipificó mediante secuenciación basada en amplicón del gen 18S-rRNA, lo que reveló la circulación de los subtipos ST1 (43,4 %), ST3 (35,85 %) y ST5 (20,75 %) entre la población del estudio. Descubrimos que los pacientes B+/C+ tenían una mayor abundancia de algunas bacterias beneficiosas (como las productoras de butirato o bacterias con propiedades antiinflamatorias) en comparación con los pacientes no colonizados con Blasto cystis, lo que puede sugerir un cambio hacia un aumento de bacterias beneficiosas. ria cuando Blastocystis coloniza a pacientes con CDI. En cuanto a las comunidades eucariotas, no se observaron diferencias estadísticas en la abundancia de algunos géneros eucariotas entre los grupos de estudio. Por lo tanto, este estudio proporciona información descriptiva preliminar de un perfil de microbiota potencial de presencia diferencial por Blastocystis y C. difficile.
Abstract
Blastocystis and Clostridioides difficile co-occurrence is considered a rare event since the colonization by Blastocystis is prevented under a decrease in beneficial bacteria in the microbiota when there is C. difficile infection (CDI). This scenario has been reported once, but no information on the gut microbiota profiling is available. The present study is motivated by knowing which members of the microbiota can be found in this rare scenario and how this co-occurrence may impact the abundance of other bacteria, eukaryotes or archaea present in the gut microbiota. This study aimed to describe the bacterial and eukaryotic communities using amplicon-based sequencing of the 16S- and 18S-rRNA regions of three patient groups: (1) Blastocystis and C. difficile infection (B+/C+, n = 31), (2) C. difficile infection only (B−/C+, n = 44), and (3) without Blastocystis or C. difficile (B−/C−, n = 40). Blastocystis was subtyped using amplicon-based sequencing of the 18S-rRNA gene, revealing circulation of subtypes ST1 (43.4%), ST3 (35.85%) and ST5 (20.75%) among the study population. We found that B+/C+ patients had a higher abundance of some beneficial bacteria (such as butyrate producers or bacteria with anti-inflammatory properties) compared with non-Blasto cystis-colonized patients, which may suggest a shift towards an increase in beneficial bacte ria when Blastocystis colonizes patients with CDI. Regarding eukaryotic communities, statistical differences in the abundance of some eukaryotic genera between the study groups were not observed. Thus, this study provides preliminary descriptive information of a potential microbiota profiling of differential presence by Blastocystis and C. difficile.
Palabras clave
Bacterias , Biomarcadores , Blastocistis , Eucariota , Hongos , Tracto gastrointestinal , Bacterias intestinales , Protistas
Keywords
Biomarkers , Blastocystis , Eukaryota , Fungi , Gastrointestinal tract , Gut bacteria , Protists
