Ítem
Acceso Abierto
Comparación de los perfiles de expresión génica de una cepa asociada a un presunto brote oral y un caso crónico de la enfermedad de Chagas
Título de la revista
Autores
Velandia González, Lina Sofia
Fecha
2023-07-14
Directores
Cruz Saavedra, Lissa
Ramírez González, Juan David
ISSN de la revista
Título del volumen
Editor
Universidad del Rosario
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Resumen
Trypanosoma cruzi es el causante de la enfermedad de Chagas (CD). Los brotes orales de CD han aumentado en los últimos años, y las cepas causantes de estos se han asociado a una sintomatología aguda y mayor mortalidad. En estos brotes, el parásito expresa proteínas de familias multigénicas como la transialidasa gp82; no obstante, no se ha observado la remodelación transcriptómica que puede llevar a cabo un cepa asociada a Chagas oral. Por lo anterior, en este estudio se comparó la remodelación transcriptómica del parásito de una cepa aislada de un presunto brote oral (JJ21) y de una cepa aislada de caso crónico (MG) de CD en un modelo de infección de fibroblastos, a las 24 y 72 horas post-infección. Para ello, se analizó el transcriptoma de ambas cepas, y se evidenció los genes diferencialmente expresados (DEGs, por sus siglas en inglés), ontologías génicas y vías diferencialmente expresadas gracias a TriTrypDB y KAAS. Se encontró que en la cepa JJ21 a las 24 horas se subexpresaron DGF-1, GP63 y Ts, mientras que se sobreexpresaron las TsII, TsV, MASP y TcMUCII. A las 72 horas, en la cepa JJ21 se subexpresaron DGF-1, GP63 y TcMUCII, y que se sobreexpresaron las TcMUC. Adicionalmente, a las 72 horas de la cepa JJ21 se sobreexpresaron procesos catabólicos. De la misma manera, se reconstruyó la vía de los ribosomas para la cepa JJ21, lo que sugiere la expresión diferencial de transcritos de proteínas ribosómicas entre cepas. En conclusión, en la cepa presuntamente asociada a un brote oral se logró determinar que existe un cambio en la expresión diferencial asociada a transcritos de proteínas de ribosomas y de familias multigénicas de proteínas. Las diferencias encontradas son el primer paso para entender los cambios entre cepas con distintos mecanismos de infección a un nivel de remodelación transcriptómica.
Abstract
Trypanosoma cruzi is the etiologic agent of Chagas disease (CD). Oral outbreaks of CD have increased in recent years, and the strains responsible for these outbreaks have been associated with acute symptoms and higher mortality rates. In these outbreaks, transcripts from multigene families such as transialidase gp82 are expressed. However, no transcriptomic remodeling has been observed in an oral Chagas strain. This study aimed to compare the transcriptomic remodeling in the parasite in a strain isolated from a suspected oral outbreak (JJ21) and a strain isolated from a chronic case (MG) of Chagas disease in a fibroblast infection model, at 24- and 72-hours post-infection. The transcriptome of both strains was analyzed, and differential expressed genes (DEGs), gene ontologies, and differentially expressed pathways were identified using TriTrypDB and KAAS. DGF-1, GP63, and Ts were downregulated in the JJ21 strain at 24 hours, while TsII, TsV, MASP, and TcMUCII were upregulated. At 72 hours, DGF-1, GP63, and TcMUCII were downregulated in the JJ21 strain and TcMUC was upregulated. Additionally, at 72 hours in the JJ21 strain, catabolic processes were overexpressed. Similarly, the ribosome pathway was reconstructed for the JJ21 strain, suggesting differential expression of ribosomal transcripts between strains. In conclusion, the oral outbreak strain has changes in expression of transcripts from ribosomal proteins and multigene protein families. The differences found are the first step towards understanding the transcriptomic remodeling in strains with different infection mechanisms.
Palabras clave
Trypanosoma cruzi , transcriptómica , genes diferencialmente expresados , brote oral
Keywords
Trypanosoma cruzi , Transcriptomics , Differential expressed genes , Oral outbreak
