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Deciphering the introduction and transmission of SARS-CoV-2 in the Colombian Amazon Basin

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dc.contributor.advisorRamírez, Juan David
dc.contributor.advisorMuñoz, Claudia Marina
dc.contributor.gruplacGrupo de Investigaciones Microbiológicas UR (GIMUR)es
dc.creatorBallesteros Chitiva, Nathalia
dc.creator.degreeMagíster en Ciencias Naturaleses
dc.creator.degreeLevelMaestríaspa
dc.creator.degreetypeFull timees
dc.date.accessioned2022-02-15T22:10:22Z
dc.date.available2022-02-15T22:10:22Z
dc.date.created2021-11-23
dc.descriptionSARS-CoV-2 ha tenido un impacto dramático en las comunidades nativas amerindias de América del Sur, especialmente en la cuenca amazónica. Con el fin de conocer la introducción e inicial propagación de este virus pandémico en esta región, realizamos un estudio de epidemiología genómica en el cual se secuenció 59 genomas de casos del departamento del Amazonas en Colombia. Nuestros resultados mostraron dos introducciones independientes del virus en el departamento, una de ellas asociada a casos asintomáticos. Representando el primer estudio de epidemiología genómica centrado en el departamento del Amazonas colombiano donde habita una gran cantidad de comunidades indígenas amerindias. Nuestros resultados proporcionan una visión de la dinámica de transmisión en esta región y reportan información relevante para buscar estrategias para mitigar la propagación del virus en la población amazónica, la cual actualmente se enfrenta a nuevos riesgos debido a la circulación de la nueva variante de preocupación P.1.es
dc.description.abstractSARS-CoV-2 has dramatically impacted Amerindian native communities across South America, particularly in the Amazonian basin. In order to unveil the introduction and initial spread of this pandemic virus into this region, we conducted a genomic epidemiology study where we sequenced 59 genomes from cases in the Amazonas department of Colombia. Our results showed two independent introductions of the virus into the department, one of these associated with asymptomatic cases. This represents the first genomic epidemiology study focused on the Colombian Amazonas department where a great amount of native Amerindian indigenous communities inhabits. Our results provide insights of the transmission dynamic in this region and reported relevant information to pursue strategies to mitigate the spread of the virus in the Amazon population which currently are facing new risks due to the circulating new variant of concern P.1.es
dc.format.extent46 ppes
dc.format.mimetypeapplication/pdfes
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.48713/10336_33680
dc.identifier.urihttps://repository.urosario.edu.co/handle/10336/33680
dc.language.isoenges
dc.publisherUniversidad del Rosario
dc.publisher.departmentFacultad de Ciencias Naturales
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Naturales
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia*
dc.rights.accesRightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses
dc.rights.accesoAbierto (Texto Completo)es
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/*
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dc.source.instnameinstname:Universidad del Rosario
dc.source.reponamereponame:Repositorio Institucional EdocUR
dc.subjectSARS-CoV-2es
dc.subjectAmazonases
dc.subjectEpidemiología genómicaes
dc.subjectDinámica de transmisiónes
dc.subjectEventos de introducciónes
dc.subject.ddcEnfermedadeses
dc.subject.keywordSARS-CoV-2es
dc.subject.keywordGenomic epidemiologyes
dc.subject.keywordAmazonases
dc.subject.keywordIntroduction eventses
dc.subject.keywordTransmission dynamices
dc.titleDeciphering the introduction and transmission of SARS-CoV-2 in the Colombian Amazon Basines
dc.title.TranslatedTitleDescifrando la introducción y transmisión de SARS-CoV-2 el la cuenca amazónica colombianaes
dc.typemasterThesiseng
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