Maestría en Genética Humana

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    Acceso Abierto
    Medicina genómica en el diagnóstico de enfermedades raras
    (Universidad del Rosario, ) Jiménez Rojas, Erika Marcela; Restrepo Fernández, Carlos Martín; Educacion Médica y en Ciencias de la Salud
    En este trabajo de investigación se analizan tres casos clínicos de condiciones raras: una enfermedad de olor inusual con gran afectación en el relacionamiento social de la persona afectada, una familia con neurodegeneración por depósito de hierro en la que se identificó un fenotipo oculto de enfermedad mental y una persona con la enfermedad de Niemann-Pick bajo tratamiento con un medicamento de alto costo cuyo diagnóstico fue erróneo. Todos ellos acudieron al Centro de Investigación en Genética y Genómica (CIGGUR) de la Universidad del Rosario, en donde se les ofreció diagnóstico genético y genómico, para entender la historia natural de cada condición, además de identificar el gen y los mecanismos biológicos que explican cada una de las condiciones, junto con el patrón de herencia, el riesgo de recurrencia y las opciones terapéuticas y preventivas disponibles a través del asesoramiento genético.
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    Acceso Abierto
    Identificación de variantes genéticas de STOX1 en mujeres colombianas con preeclampsia severa y Síndrome Hellp
    (Universidad del Rosario, ) Parada Niño, Laura Catalina; Fonseca Mendoza, Dora Janeth
    La preeclampsia (PE) es un problema de salud pública donde el diagnóstico temprano es vital. Dada la potencial implicación de STOX1 en fisiopatología de PE, este trabajo analizó ORF describiendo variantes genéticas en una muestra de mujeres colombianas con preeclampsia severa y síndrome HELLP
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    Acceso Abierto
    Identificación de interacciones proteicas de BMPR2 en un contexto ovárico y estudio de la potencial implicación de BMPR2 p.ser987phe en la etiología de la insuficiencia ovárica primaria
    (Universidad del Rosario, ) Suárez, Yohjana Carolina; Fonseca Mendoza, Dora Janeth
    La insuficiencia ovárica primaria (IOP) se caracteriza por la pérdida de la función ovárica antes de los 40 años y es una de las principales causas de infertilidad en la mujer. La prevalencia de la IOP es cercana al 1% y se ha relacionado etiológicamente con eventos iatrogénicos, agentes infecciosos, condiciones autoinmunes, desórdenes metabólicos y causas ambientales. Sin embargo, la mayoría de los casos son idiopáticos. Se ha sugerido un origen genético y epigenético de la enfermedad. Hasta la fecha, se ha identificado un número limitado de mutaciones que han sido validadas por ensayos funcionales. En el grupo investigación de la Universidad del Rosario, CIGGUR, Fonseca et al., realizaron un estudio utilizando secuenciación de siguiente generación (NGS), en 12 pacientes afectadas por IOP, identificando la mutación c.2960C>T (p. Ser987Phe) en el gen BMPR2. En el contexto del ovario, BMPR2 se expresa en células de la granulosa, se une a ligandos como BMP15 Y GDF9 y participa en la vía de señalización de BMP/SMAD. Se ha sugerido una relación funcional entre esta mutación y la etiología de la IOP. En el presente trabajo de tesis se buscaron las potenciales proteínas de interacción con BMPR2, mediante un ensayo de doble híbrido en levaduras (Y2H), utilizando una librería de ovario de ratón. Se identificaron cuatro proteínas con una alta probabilidad de interacción: Limk1, Ctnnd1, Fasn y Fn1. Posteriormente, para la validación de los resultados se efectuó un ensayo de doble hibrido en células CHO, entre las versiones de BMPR2 wild type/mutante y las secuencias de LIMK1 y p120. Este ensayo permitió identificar que existe una potencial interacción entre los segmentos proteicos de LIMK1 y BMPR2 wild type en un contexto ovárico. Sin embargo, no se evidenció una perturbación en la interacción proteica entre BMPR2 mutante y LIMK1. Respecto a p120, no se logró replicar los hallazgos obtenidos en Y2H para su interacción proteica con BMPR2. Estos resultados no excluyen las posibles interacciones de BMPR2 con LIMK1 y p120. Se recomienda considerar otras técnicas de validación de interacción proteína-proteína (e.g. co-inmunoprecipitación) y evaluar los posibles efectos sobre las vías de señalización asociadas a BMPR2.
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    Acceso Abierto
    Dinámica de la carga viral de seis tipos de VPH de alto riesgo en presencia de infecciones por Chlamydia trachomatis
    (Universidad del Rosario, ) Baez Murcia, Indira Maria; Patarroyo, Manuel A.
    Diversos patógenos que se han asociado a las infecciones de transmisión sexual (ITS), siendo considerados de gran importancia a nivel mundial por el impacto y las consecuecias que generan, principalmente en términos de salud pública. Tal como la relación causal entre la persistencia de la infección de los tipos del virus de papiloma humano (VPH) considerado de alto riesgo, con el daño progresivo del cérvix y el desarrollo de cáncer cervical (CC). Se ha demostrado que la presencia únicamente del VPH no es suficiente para que esta progresión se genere, lo que ha sugerido que la presencia de otros cofactores pueden influir en el curso clínico y desenlace de la infección por VPH. En este estudio, se analizó la depuración y persistencia de la coexistencia de dos infecciones de transmisión sexual, una viral (VPH) y otra bacteriana (Chlamydia trachomatis - Ct) en una población de mujeres colombianas que asisten a los programas de promoción y prevención para el control del cáncer cervical. Fueron incluidas 310 mujeres, las cuales se les tomó durante un periodo de tres años muestras periodícamente, con una diferencia de 6 meses entre cada visita (±3 meses). En todas las mujeres incluidas se llevó a cabo la identificación y cuantificación molecular de 6 tipos de VPH de alto riesgo (VPH-16, -18, -31, -33, -45 y -58), así como la detección de la infección por Ct. Los resultados del estudio mostraron para la líne base (primera muestra) una frecuencia una infección por VPH de 71,3% y por Ct 28,1%, la coexistencia entre VPH y Ct fue del 26,2%; la mayor detección viral ocurrió en el seguimiento 2 (79,4%), mientras que para Ct fue en el seguimiento 4 (36,6%); en cuanto a la distribución tipo-específica,los tipos VPH-16 y -31 fueron los de mayor aparición a lo argo de los seguimientos, en cuanto a al número de copias de VPH los resulatdos mostraron que esta fue mayor en mujeres que cursaban simultáneamente con infección por Ct (mediana: 424, IQR: 19300), este comportamiento se observo para la mayor parte de los tipos virales con la excepción de HPV-33 donde la carga viral fue mayor en aquellas mujeres sin infección bacteriana (mediana: 3640, IQR: 101864). Una regresión logística con medidas repetidas en el tiempo GEE mostró que la carga de VPH es modulada por factores como el origen de las pacientes (para VPH-16), la étnia (para VPH-16), el método de planificación familiar (para VPH-16 y -45), número de gestaciones (para VPH-16, -18 y -33), menopausia (para VPH-16) y número de compañeros sexuales (para VPH-45). Finalmente, la fuerza de la asociación entre la presencia de Ct y el riesgo de tener una infección por VPH se cuantificó mediante el uso del estimador de riesgo hazard ratio (HR), se observaron de riesgo para la coexistencia con la Ct la detección de VPH (HR = 2,06; IC 95%: 1,46 a 2,89), infecciones por VPH-33 (HR = 1,45; IC 95%: 1,12 a 1,86) e infecciones por VPH-58 33 (HR = 1,37; IC 95%: 1,05 a 1,78). Este estudio longitudinal involucró mujeres de tres poblaciones heterogéneas socio-demográficamente de Colombia, proporcionaron datos sobre la distribución de la coinfección por dos de las ITS de mayor aparición a nivel mundial, por lo que la comprensión del papel que desempeñan otros patógenos resulta relevante y plantea nuevos retos en el abordaje e implementación de estrategias acertadas que mejoren y prolonguen la calidad de vida en la población.
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    Acceso Abierto
    Producción de anticuerpos monoclonales que reconozcan proteínas de membrana en células de memoria en aotus spp
    (Universidad del Rosario, 2019) Cubides Amézquita, Jenner Rodrigo; Patarroyo, Manuel A.
    A pesar de que varios candidatos a la vacuna contra la malaria se encuentran actualmente ensayos de fase clínica 2 y 3, sus mecanismos de protección inmunológica no se comprenden completamente y la duración de la protección de la vacuna se desconoce en gran medida. El modelo del mono Aotus spp. ha sido recomendado por la Organización Mundial de la Salud para el estudio de los candidatos a la vacuna contra la malaria debido a las fuertes similitudes con la patología y los antecedentes genéticos observados en humanos. Sin embargo, la falta de anticuerpos específicos para los marcadores de superficie molecular de las células inmunes en Aotus, ha retrasado los avances en la investigación de la malaria. Entre los anticuerpos monoclonales comerciales (mAbs) para los marcadores moleculares de células T de memoria CD19 +, CD27 + B y CD4 +, CD45RO +, solo los del clon SK3 reconocieron las células T Aotus CD4. En este trabajo, los enfoques bioinformáticos fueron usados para diseñar péptidos antigénicos que corresponden a las regiones extracelulares de las proteínas de membrana CD19, CD27, CD4 y CD45RO, para producir mAbs. 1746 clones de hibridoma resultantes reconocieron los marcadores de superficie molecular de las células inmunes por citometría de flujo y el 30% de ellos se unen al péptido sintético por ELISA. Los mAbs, CD194G12A3G3, CD275F11C11, CD45H3D10 y CD45RO3A8G1 se unieron al 17,7%, 40,1%, 27,4 y 51% de los PBMC de Aotus con alta afinidad (100 ng / 106 células) pero solo mostraron afinidad media a las células humanas (300 ng / 106 células) en análisis FACS. En los ensayos de doble marcaje de las células B y T, mostró que los mAbs CD194G12A3G3 y CD275F11C11 reconocieron el 15,9%, y CD45H3D10 y CD45RO3A8G1 se unieron al 20,6% de las PBMC de Aotus, lo que sugiere que los mAbs reconocieron los marcadores de proteínas de membrana de las células B y T. Estos mAbs son útiles para la identificación y el seguimiento de las células de memoria en el modelo de Aotus para dilucidar qué células inmunes humanas pueden mediar la protección contra la malaria.